الطفرة الهوميوتية تحوّل جزءًا من الجسم إلى آخر: وهي كلمة بيتسون (1894) للشذوذات التي “تُحلّ عضوًا من سلسلة محل آخر”. ففي الذبابة، تنمي طافرات Antennapedia السائدة أرجلًا حيث ينبغي أن تكون قرون الاستشعار؛ وتحوّل طافرات bithorax (لويس، 1978) القطعة الصدرية الثالثة إلى نسخة من الثانية، فتصير الموازنات (الدبوسيات) زوجًا ثانيًا من الأجنحة. والمورّثات الثماني المسؤولة، وهي مورّثات Hox، تقع في عنقودين على صبغي واحد، ولاحظ لويس أن ترتيبها على امتداد DNA يطابق ترتيب القطع التي تتحكم بها على امتداد الجسم — أي التوافق الخطي، الذي لم يُفسَّر بعد تفسيرًا تامًا. وترمّز كل منها عامل استنساخ بنطاق الهوميوبوكس نفسه الرابط لجزيء DNA والمؤلَّف من ستين حمضًا أمينيًا (مكغينيس، وغيرنغ، 1984)، وقد وُجد بعد ذلك في كل حيوان: فللفئران والبشر أربعة عناقيد من ثلاث عشرة مورّثة لكل عنقود، متوافقة خطيًا بالطريقة نفسها، معبَّرًا عنها في نطاقات متداخلة على امتداد محور الجسم، والمورّثات المتأخرة في العنقود أكثر خلفيةً. وهوية الخلية على امتداد المحور يعطيها توافيق مورّثات Hox التي تعبّر عنها، أي شفرة Hox؛ والمورّثات الخلفية تغلب الأمامية (الغلبة الخلفية)، ففقد مورّثة خلفية يدع القطعة تتخذ هوية التي أمامها. ومورّثات Hox لا تبني قطعة؛ بل تخبر قطعة مبنيّة أصلًا أيَّ قطعة هي، بتشغيل بطاريات المورّثات التالية المناسبة لرجل أو جناح أو ضلع أو فقرة قطنية.