Una región intrínsecamente desordenada no tiene plegamiento estable por sí sola y existe como un conjunto de conformaciones que se interconvierten deprisa, y a menudo se pliega solo al encontrarse con su compañera; alrededor de un tercio de las proteínas humanas llevan una región desordenada de más de treinta residuos, y están enriquecidas en la señalización y la regulación, donde un segmento flexible puede fosforilarse en muchos sitios, unirse por turnos a varias compañeras y actuar de enlace. Las proteínas plegadas también se mueven: las cadenas laterales giran en picosegundos, los bucles se abren en nanosegundos o microsegundos, los dominios bisagran en microsegundos o milisegundos, y el ciclo catalítico de una enzima es una coreografía de tales movimientos más que una llave estática en su cerradura. Una estructura cristalina es una instantánea de un conjunto conformacional; la RMN y la simulación molecular ven el resto. Las proteínas desordenadas multivalentes y los ARN pueden además separarse del citoplasma en gotas líquidas — los condensados biomoleculares, como los nucléolos, los gránulos de estrés y los cuerpos P — que concentran reacciones sin membrana, y cuyo envejecimiento hasta agregados sólidos es una de las vías hacia las enfermedades amiloides.
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