L’entrée corticale gagne l’hippocampe par le cortex entorhinal et traverse trois étages : le gyrus denté, dont les cellules granulaires sont plus nombreuses que leurs entrées et déchargent parcimonieusement (ce qui sépare les motifs semblables) ; CA3, dont les cellules pyramidales sont connectées récurremment les unes aux autres, chacune recevant des milliers de synapses des autres — un réseau autoassociatif qui sait compléter un motif stocké à partir d’un fragment ; et CA1, qui compare la sortie de CA3 à l’entrée directe et renvoie le résultat au cortex. Chez un rat qui explore une arène, une cellule pyramidale de l’hippocampe ne décharge que lorsque l’animal est à un endroit — une cellule de lieu (O’Keefe, 1971) — et quelques centaines d’entre elles cartographient l’arène ; en amont, dans le cortex entorhinal, les cellules de grille (Moser, 2005) déchargent aux sommets d’un réseau hexagonal qui couvre l’espace, système de coordonnées à partir duquel se construisent les champs de lieu. Pendant le sommeil et le repos les séquences de cellules de lieu qui ont déchargé pendant un parcours sont rejouées à grande vitesse, et bloquer le rejeu abîme le souvenir du parcours : l’hippocampe répète au cortex les chemins de la journée.