Une vésicule de transport est façonnée par un manteau de protéines assemblé sur la face cytosolique d’une membrane, qui courbe celle-ci en un bourgeon de , rassemble la cargaison grâce à des récepteurs qui traversent la membrane, et se défait une fois la vésicule détachée. Trois manteaux desservent les routes principales : COPII pour les vésicules qui quittent le réticulum vers le Golgi, COPI pour le trafic de retour du Golgi vers le réticulum et entre citernes golgiennes, et la clathrine — protéine à trois pieds qui polymérise en une cage d’hexagones et de pentagones — pour les vésicules qui quittent le Golgi trans vers les endosomes et pour l’endocytose à la membrane plasmique, où des protéines adaptatrices relient la cage aux récepteurs à internaliser. Chaque manteau est recruté par une petite GTPase (Sar1 pour COPII, Arf1 pour COPI et la clathrine) qui s’insère dans la membrane sous sa forme GTP et, en hydrolysant le GTP après le bourgeonnement, laisse tomber le manteau. Des signaux de récupération maintiennent les compartiments distincts : les protéines du réticulum échappées et porteuses de KDEL sont reconnues dans le Golgi par un récepteur et ramenées dans des vésicules COPI.