कोई छँटाई संकेत किसी प्रोटीन का कोई खंड, या उसका कोई रूपांतरण है, जिसे कोई ग्राही पढ़कर प्रोटीन को किसी एक कक्ष तक पहुँचा देता है। संकेत पेप्टाइड, यानी अमीनो सिरे पर जलविरोधी क्रोड वाला अवशेषों का कोई खंड, किसी प्रोटीन को बनते-बनते ही अंतर्द्रव्यी जालिका में भेज देता है; वहाँ से चूक-मार्ग गॉल्जी से होकर जीवद्रव्य-कला तक या बाहर तक जाता है, और आगे के संकेत उसे लयनकाय की ओर (कोई फ़ॉस्फ़ोरिलित शर्करा) या जालिका में वापस (कार्बोक्सी-सिरे का अनुक्रम KDEL) मोड़ देते हैं। कोई केंद्रक-स्थानिकीकरण संकेत, यानी PKKKRKV जैसा कोई छोटा क्षारीय टुकड़ा, इंपोर्टिनों से बँधता है जो वलित प्रोटीन को केंद्रक-छिद्र से पार ले जाते हैं; कोई सूत्रकणिकीय पूर्वानुक्रम, यानी अवशेषों की कोई उभयरागी कुंडली, बाहरी झिल्ली के ग्राहियों से पहचाना जाता है और दोनों झिल्लियों के स्थानांतरकों से, अवलित, पिरो दिया जाता है; परऑक्सीकायी एंज़ाइमों का अंत SKL पर होता है। जिन प्रोटीनों में इनमें से कुछ नहीं होता वे कोशिकाद्रव्य में रह जाते हैं। हर संकेत उसी एक ढंग से मिला: उसे हटा दीजिए तो प्रोटीन कोशिकाद्रव्य में रह जाता है, उसे किसी कोशिकाद्रव्यी प्रोटीन पर जोड़ दीजिए तो वह प्रोटीन उस कक्ष में चला जाता है।
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