CoachUm motivo é um padrão curto — um sítio de fator de transcrição, um sinal de splicing, um sítio de fosforilação — representado por uma matriz de pesos por posição com a frequência de cada base ou resíduo em cada posição . O conteúdo de informação da posição é bits para o DNA, em que é sua entropia: bits para uma base invariante, para uma posição em que as quatro são igualmente prováveis. O total é desenhado como um logo de sequência, cada posição uma pilha de letras cuja altura total é e cujas letras têm tamanho proporcional à frequência.
উদাহরণ
Exemplo 5.14 (Correspondências esperadas ao acaso)
Um sítio de restrição de seis bases fixas tem bits e corresponde a uma posição aleatória com probabilidade : cerca de vezes num genoma de E. coli de lido nas duas fitas (o sítio é palindrômico, e portanto uma vez por posição) e vezes no genoma humano. Um fator eucarionte cujo motivo carrega bits corresponde a milhões de posições no genoma humano, vários milhares de vezes mais do que os genes que ele regula. Um motivo sozinho é um previsor fraco num genoma grande; o estado da cromatina, os motivos vizinhos e a conservação do sítio entre espécies é que fazem uma previsão.