CoachUn motivo es un patrón corto — un sitio de factor de transcripción, una señal de corte, un sitio de fosforilación — representado por una matriz de pesos por posición con la frecuencia de cada base o residuo en cada posición . El contenido de información de la posición es bits para el ADN, donde es su entropía: bits para una base invariante y para una posición en la que las cuatro son igualmente probables. El total se dibuja como un logotipo de secuencia, con cada posición una pila de letras cuya altura total es y cuyas letras se dimensionan por frecuencia.
উদাহরণ
Ejemplo 5.14 (Coincidencias esperadas por azar)
Un sitio de restricción de seis bases fijas tiene bits y coincide con una posición al azar con probabilidad : unas veces en un genoma de E. coli de leído en ambas hebras (el sitio es palindrómico, de modo que una vez por posición), y veces en el genoma humano. Un factor eucariota cuyo motivo lleve bits coincide con millones de posiciones del genoma humano, varios miles de veces más que los genes que regula. Un motivo por sí solo es un predictor débil en un genoma grande; lo que permite una predicción son el estado de la cromatina, los motivos vecinos y la conservación del sitio entre especies.