CoachLes antiviraux s’attaquent aux enzymes virales ou aux étapes qu’une cellule hôte n’accomplit pas. Les analogues nucléosidiques sont des terminateurs de chaîne : l’aciclovir n’est phosphorylé que par la thymidine kinase de l’herpèsvirus et bloque ensuite l’ADN polymérase virale, de sorte qu’il n’agit que dans les cellules infectées ; l’AZT, le ténofovir et la lamivudine arrêtent la transcriptase inverse ; le remdésivir et le molnupiravir agissent sur la polymérase des coronavirus, le second par mutagenèse. Les inhibiteurs de protéase bloquent le clivage des polyprotéines virales (VIH, hépatite C, le nirmatrelvir contre le SARS-CoV-2). Les inhibiteurs d’intégrase empêchent la formation du provirus du VIH ; les inhibiteurs de neuraminidase empêchent les virions de la grippe de se détacher de la cellule dont ils bourgeonnent ; les inhibiteurs d’entrée bloquent un récepteur. Le virus de l’hépatite C se guérit aujourd’hui en douze semaines par des associations de médicaments à action directe, première infection virale chronique jamais guérie par une chimiothérapie. Les vaccins présentent les antigènes du virus sans sa maladie : un virus vivant atténué (rougeole, polio par voie orale, fièvre jaune), un virus inactivé (polio injectable, grippe), une sous-unité (l’antigène de surface de l’hépatite B fabriqué dans la levure, la protéine de capside du papillomavirus), un vecteur viral inoffensif porteur d’un gène de la cible, ou, depuis 2020, un ARN messager codant l’antigène, livré dans des nanoparticules lipidiques, que les cellules mêmes du vacciné traduisent. L’immunologie qui explique pourquoi ils marchent, et combien de personnes il faut vacciner pour protéger les autres, fait l’objet du Chapitre 16.
Exemples
Exemple 13.6 (Le VIH avant et après les équations)
Jusqu’en 1995, les années de latence clinique de l’infection par le VIH — une charge virale stable de – copies par millilitre et une lente chute des lymphocytes T — se lisaient comme un virus au repos. Ho, Perelson et leurs collègues ont donné à des patients un inhibiteur de protéase et ont ajusté la décroissance de la charge virale au théorème : la phase rapide a donné (une demi-vie du virion d’environ six heures), la phase lente (une cellule infectée vit environ un jour et demi). Une charge stable de par millilitre dans de liquides corporels, éliminée à , exige donc la production d’environ virions par jour, chaque jour, pendant des années : la période « latente » est un état stationnaire furieux d’infection et de mort, le stock de lymphocytes T étant remplacé chaque jour jusqu’à ce qu’il cède. L’arithmétique des mutations de la section suivante en découle aussitôt, et avec elle la raison pour laquelle les médicaments seuls ont échoué et trois ensemble non.
Exemple 13.9 (Pourquoi le VIH a exigé trois médicaments)
La transcriptase inverse du VIH se trompe environ une fois sur nucléotides, de sorte que chaque génome de copié porte environ mutation, et que génomes neufs par jour en portent à eux tous : chacune des mutations ponctuelles possibles apparaît de nombreuses fois chaque jour, avant même qu’aucun médicament soit donné. Un médicament qu’une seule mutation met en échec — comme une seule mutation met en échec la plupart des inhibiteurs de la transcriptase inverse et de la protéase — est donc défait en quelques semaines, ce qui est arrivé à l’AZT en 1987. Deux mutations indépendantes apparaissent ensemble à par génome, soit environ une fois par jour ; trois à , une fois en mille jours — et un patient sous trois médicaments dont la charge a chuté d’un facteur mille produit génomes par jour, de sorte que le triple mutant n’apparaît jamais. Cela, et la démonstration par le théorème que le virus se répliquait à plein régime, ont fait de la trithérapie, dès 1996, le traitement qui a fait du sida une maladie chronique.