Obat antivirus menyerang enzim virus atau langkah yang tidak dilakukan sel inang. Analog nukleosida adalah penamat rantai: asiklovir difosforilasi hanya oleh timidin kinase herpesvirus lalu menghalangi DNA polimerase virus, sehingga ia bekerja hanya di dalam sel terinfeksi; AZT, tenofovir, dan lamivudin menghentikan transkriptase balik; remdesivir dan molnupiravir bekerja pada polimerase koronavirus, yang kedua lewat mutagenesis. Penghambat protease menghalangi pemotongan poliprotein virus (HIV, hepatitis C, nirmatrelvir bagi SARS-CoV-2). Penghambat integrase menghentikan pembentukan provirus HIV; penghambat neuraminidase menghentikan virion influenza melepaskan diri dari sel yang darinya ia menguncup; penghambat pemasukan menghalangi sebuah reseptor. Virus hepatitis C kini disembuhkan dalam dua belas minggu oleh gabungan obat yang bekerja langsung, yakni infeksi virus menahun pertama yang pernah disembuhkan oleh kemoterapi. Vaksin menyajikan antigen virus tanpa penyakitnya: sebuah virus hidup yang dilemahkan (campak, polio lewat mulut, demam kuning), sebuah virus yang dimatikan (polio lewat suntikan, influenza), sebuah subunit (antigen permukaan hepatitis B yang dibuat di dalam khamir, protein kapsid virus papiloma), sebuah vektor virus tak berbahaya yang mengusung sebuah gen sasarannya, atau, sejak tahun 2020, RNA duta yang menyandi antigennya, yang diantarkan di dalam nanopartikel lipid, yang diterjemahkan oleh sel penerimanya sendiri. Imunologi mengapa semuanya bekerja, dan berapa banyak orang yang harus divaksinasi untuk melindungi sisanya, adalah pokok Bab 16.
Contoh
Contoh 13.6 (HIV sebelum dan sesudah persamaannya)
Sampai tahun 1995 tahun-tahun latensi klinis infeksi HIV — muatan virus yang mantap sebesar – salinan per mililiter dan penurunan lambat sel T — dibaca sebagai virus yang lelap. Ho, Perelson, dan rekannya memberi pasien sebuah penghambat protease lalu mencocokkan penurunan muatan virus itu dengan teoremanya: fase cepatnya memberi (paruh hidup virion sekitar enam jam), fase lambatnya (sebuah sel terinfeksi hidup sekitar satu setengah hari). Muatan mantap sebesar per mililiter di dalam cairan tubuh, yang disingkirkan dengan laju , karena itu menuntut produksi sekitar virion sehari, tiap hari, bertahun-tahun: masa “laten” itu adalah keadaan mantap infeksi dan kematian yang garang, dengan kumpulan sel T tergantikan tiap hari sampai ia gagal. Aritmetika mutasi pada bagian berikutnya lalu menyusul seketika, dan bersamanya alasan mengapa obat tunggal gagal sementara tiga obat tidak.
Contoh 13.9 (Mengapa HIV memerlukan tiga obat)
Transkriptase balik HIV keliru sekitar sekali tiap nukleotida, sehingga tiap genom yang disalin mengusung sekitar mutasi, dan genom baru sehari mengusung mutasi di antaranya: tiap satu dari mutasi titik tunggal yang mungkin muncul berkali-kali setiap hari, sebelum obat apa pun diberikan. Sebuah obat yang dikalahkan satu mutasi — sebagaimana satu mutasi mengalahkan kebanyakan penghambat transkriptase balik dan penghambat protease — karena itu dikalahkan dalam hitungan minggu, dan itulah yang menimpa AZT pada tahun 1987. Dua mutasi yang saling bebas muncul bersama pada per genom, sekitar sekali sehari; tiga mutasi pada , sekali tiap seribu hari — dan seorang pasien dengan tiga obat yang muatannya telah turun seribu kali lipat menghasilkan genom sehari, sehingga mutan rangkap tiga itu tidak pernah muncul. Hal itu, dan pembuktian teoremanya bahwa virusnya sedang menggandakan diri dengan kecepatan penuh, menjadikan terapi gabungan sejak tahun 1996 pengobatan yang mengubah AIDS menjadi sebuah keadaan menahun.