ऊष्मा, या चरम pH, DNA की दोनों लड़ियाँ अलग कर देती है: विकृतीकरण (पिघलना), यानी कुछ ही डिग्री पर होता एक सहकारी संक्रमण, जिसका मध्यबिंदु गलन ताप है। उसके साथ अतिवर्णी प्रभाव आता है: एकल लड़ियाँ पर उन्हीं क्षारकों से लगभग अधिक पराबैंगनी प्रकाश अवशोषित करती हैं जो किसी कुंडली में चिने हों। की मात्रा के साथ बढ़ता है (प्रति प्रतिशत ), लवण की सांद्रता के साथ, और लंबाई के साथ; लवण में का कोई लंबा DNA के पास पिघलता है। धीरे-धीरे ठंडा करने पर लड़ियाँ अपने पूरक ढूँढ़ लेती हैं और कुंडली फिर बना लेती हैं: पुनर्प्राकृतिकरण, या संकरण जब लड़ियाँ अलग-अलग स्रोतों से आई हों।
उदाहरण
उदाहरण 11.11 (कोई प्रोब किसी जीन को खोज लेता है)
किसी एक जीन की पूरक बीस न्यूक्लियोटाइडों की कोई प्रोब, अपने ही से नीचे, तीन अरब क्षारक युग्मों में अपना ठीक पूरक बाँधती है और कुछ नहीं: बीस में एक भी बेमेल को कई डिग्री गिरा देता है और बेमेल संकर पिघल जाता है। बीस स्थानों पर गुणित क्षारक-युग्मन की यही विशिष्टता वह चीज़ है जिस पर पितृत्व से लेकर रोगजनक-पहचान तक हर DNA जाँच टिकी है।