कोई न्यूक्लियोटाइड तीन भागों का बना है: एक नाइट्रोजनी क्षारक — कोई प्यूरीन (ऐडेनीन A, ग्वानीन G: दो संगलित वलय) या कोई पिरिमिडीन (साइटोसीन C, थाइमीन T, यूरैसिल U: एक वलय); पाँच कार्बन की एक शर्करा, RNA में राइबोस या DNA में 2′-डिऑक्सीराइबोस (जिसमें कार्बन 2′ पर हाइड्रॉक्सिल नहीं होता); और शर्करा के कार्बन 5′ पर एक से तीन तक फ़ॉस्फ़ेट समूह। क्षारक कार्बन 1′ से जुड़ता है; और शर्करा के कार्बनों को क्षारक के कार्बनों से अलग दिखाने के लिए अंकों पर प्राइम लगाया जाता है। क्षारक और शर्करा मिलकर कोई न्यूक्लियोसाइड (ऐडेनोसिन, ग्वानोसिन, साइटिडीन, थाइमिडीन, यूरिडीन) हैं; और फ़ॉस्फ़ेटों के साथ वह न्यूक्लियोटाइड (AMP, ADP, ATP और उनके सजातीय)।
उदाहरण
उदाहरण 11.4 (RNA नाज़ुक है, DNA टिकाऊ)
राइबोस का 2′ हाइड्रॉक्सिल पड़ोसी फ़ॉस्फ़ोडाइएस्टर बंध पर हमला कर सकता है: हल्के क्षार में RNA घंटों के भीतर जल-अपघटित होकर न्यूक्लियोटाइड बन जाता है, जबकि DNA, जिसमें वह हाइड्रॉक्सिल नहीं है, क्षार में उबाल सह लेता है और दसियों हज़ार वर्ष पुरानी हड्डियों से साबुत निकाला जा चुका है। RNA का यूरैसिल बिना मेथिल समूह का थाइमीन है; DNA थाइमीन इसलिए काम में लेता है कि साइटोसीन, जो धीरे-धीरे अपना ऐमीनो समूह खोकर यूरैसिल बन जाता है, क्षति के रूप में पहचाना और मरम्मत किया जा सके — DNA में कोई यूरैसिल सदा एक भूल है।
उदाहरण 11.7 (किसी लड़ी को पढ़ना)
यदि एक लड़ी 5′-ATGGCATTC-3′ पढ़ी जाए, तो उसकी साथी, जिसे 5′→3′ लिखा जाता है, 5′-GAATGCCAT-3′ है: हर क्षारक का पूरक लीजिए, फिर क्रम उलट दीजिए। नौ युग्म, 3.1nm कुंडली, बाईस हाइड्रोजन बंध (पाँच G–C, चार A–T)। 2.5×108 युग्मों का कोई मानव गुणसूत्र इस रूप में 8.5cm लंबा है और किसी केंद्रक में समाने के लिए उसे एक लाख गुना मुड़ना पड़ता है (अध्याय 17)।
उदाहरण 11.11 (कोई प्रोब किसी जीन को खोज लेता है)
किसी एक जीन की पूरक बीस न्यूक्लियोटाइडों की कोई प्रोब, अपने ही Tm से 5∘C नीचे, तीन अरब क्षारक युग्मों में अपना ठीक पूरक बाँधती है और कुछ नहीं: बीस में एक भी बेमेल Tm को कई डिग्री गिरा देता है और बेमेल संकर पिघल जाता है। बीस स्थानों पर गुणित क्षारक-युग्मन की यही विशिष्टता वह चीज़ है जिस पर पितृत्व से लेकर रोगजनक-पहचान तक हर DNA जाँच टिकी है।