जल, , एक मुड़ा हुआ अणु है (H–O–H कोण है) जिसमें ऑक्सीजन साझा इलेक्ट्रॉनों को अपनी ओर खींचता है: वह ध्रुवीय है, और ऑक्सीजन पर आंशिक ऋण आवेश तथा हाइड्रोजनों पर आंशिक धन आवेश रखता है। हर अणु चार तक हाइड्रोजन बंध बना सकता है — यानी किसी विद्युत-ऋणात्मक परमाणु (O, N) से बँधे किसी हाइड्रोजन और किसी दूसरे विद्युत-ऋणात्मक परमाणु के एकाकी युग्म के बीच का स्थिरवैद्युत आकर्षण — दो अपने हाइड्रोजनों से और दो अपने ऑक्सीजन से। द्रव जल ऐसे ही बंधों का एक जाल है, जिनमें से हर एक कुछ पिकोसेकंड टिकता है।
उदाहरण
उदाहरण 8.3 (काम पर जलविरागी प्रभाव)
तेल को जल में हिलाइए और मिनटों में बूँदें आपस में मिल जाती हैं: जल उसे निचोड़कर बाहर कर देता है जिससे वह बंध नहीं बना सकता। यही प्रभाव किसी प्रोटीन को वलित करता है (उसके तैलीय अवशेष भीतर छिप जाते हैं, अध्याय 12), किसी झिल्ली को जोड़ता है (लिपिडों की पूँछें जल से दूर इकट्ठी हो जाती हैं, अध्याय 9), और दो मेल खाती आणविक सतहों को साथ ले आता है। तेल को तेल की ओर कुछ खींचता नहीं; जल धकेलता है।
उदाहरण 8.6 (किसी द्विकुंडली को पिघलाना)
DNA की दोनों लड़ियाँ प्रति क्षारक युग्म दो या तीन हाइड्रोजन बंधों और पड़ोसी युग्मों के स्तरण (वान डर वाल्स) से थमी हैं; कोई अकेला युग्म तुरंत अलग हो जाता, पर एक पंक्ति में एक हज़ार युग्म तब तक थामे रहते हैं जब तक ताप लगभग तक न पहुँच जाए, और ताप घटने पर वे ठीक उसी पंजीकरण में फिर मिल जाते हैं (अध्याय 11)। विशिष्ट, संख्या में मज़बूत, उत्क्रमणीय।