Biologi · Glosarium

Apa itu Ikatan fosfodiester, kekutuban?

Dikenal juga sebagai: polinukleotida · ikatan fosfodiester · 5' end · 3' end · DNA · RNA

Definisi 11.3 Biologi Universitas — Tahun 1 · Bab 11 — Nukleotida dan Asam Nukleat

Nukleotida disambung menjadi sebuah polinukleotida lewat ikatan fosfodiester: fosfat pada karbon 55' sebuah nukleotida bertaut pada hidroksil 33' nukleotida berikutnya. Karena itu rantainya memiliki tulang punggung gula–fosfat, yang seragam dan bermuatan negatif (satu muatan tiap fosfat), yang basanya menjulur sebagai sebuah urutan; dan ia berarah: sebuah ujung 55' yang membawa fosfat bebas dan sebuah ujung 33' yang membawa hidroksil bebas. Urutannya ditulis dan dibaca 535' \to 3', yaitu arah rantainya disintesis. DNA (asam deoksiribonukleat) memakai deoksiribosa dan basa A, G, C, T; RNA (asam ribonukleat) memakai ribosa dan A, G, C, U.

Sebuah rantai empat nukleotida. Fosfat 5' tiap nukleotida tersambung pada hidroksil 3' nukleotida di atasnya lewat sebuah ikatan fosfodiester; rantainya berjalan dari sebuah ujung 5' ke sebuah ujung 3' dan basanya menggantung pada tulang punggung yang seragam.
Sebuah rantai empat nukleotida. Fosfat 55' tiap nukleotida tersambung pada hidroksil 33' nukleotida di atasnya lewat sebuah ikatan fosfodiester; rantainya berjalan dari sebuah ujung 55' ke sebuah ujung 33' dan basanya menggantung pada tulang punggung yang seragam.

Contoh

Contoh 11.4 (RNA rapuh, DNA awet)

Hidroksil 22' ribosa dapat menyerang ikatan fosfodiester di sebelahnya: dalam basa lemah RNA terhidrolisis menjadi nukleotida dalam beberapa jam, sedangkan DNA, yang tidak memiliki hidroksil itu, selamat dari pendidihan dalam basa dan telah diperoleh kembali secara utuh dari tulang berumur puluhan ribu tahun. Urasil dalam RNA adalah timina tanpa gugus metil; DNA memakai timina agar sitosina, yang perlahan kehilangan gugus aminonya menjadi urasil, dapat dikenali sebagai rusak lalu diperbaiki — sebuah urasil dalam DNA selalu sebuah kekeliruan.

Contoh 11.11 (Sebuah pelacak menemukan sebuah gen)

Sebuah pelacak dua puluh nukleotida yang melengkapi satu gen, pada 5C5\,{}^{\circ}\mathrm{C} di bawah TmT_m-nya sendiri, mengikat pasangan persisnya dan tak ada yang lain dalam tiga miliar pasangan basa: satu ketakcocokan dalam dua puluh menurunkan TmT_m beberapa derajat dan hibrid yang tak cocok itu meleleh. Kekhasan pemasangan basa, yang dilipatgandakan atas dua puluh kedudukan, adalah sandaran tiap uji DNA, dari uji kebapakan sampai pendeteksian patogen.

Baca dalam konteks →