O que é Associação genômica ampla?

Um polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) é uma posição em que duas bases ocorrem, cada uma em ao menos $1\,\%$ de uma população; cerca de dez milhões são comuns nos humanos. Um estudo de associação genômica ampla (GWAS) genotipa centenas de milhares de SNPs em milhares de pessoas com uma doença e em milhares sem ela, e pergunta, em cada SNP, se um alelo é mais frequente nos casos. Como se fazem um milhão de testes, um resultado só conta abaixo de um limiar de significância de cerca de $5\times 10^{-8}$ ($0.05$ dividido pelo milhão de testes efetivamente independentes). Os SNPs associados marcam uma região, e não uma variante causal, já que alelos vizinhos viajam juntos (desequilíbrio de ligação) ao longo de dezenas de quilobases. Para a maioria das doenças comuns, cada alelo associado desloca o risco em poucos por cento e a maior parte deles está em sequência regulatória; seu efeito combinado, somado ao longo de milhares de SNPs como um escore poligênico, explica uma fração da herdabilidade e prevê o risco mais ou menos tão bem quanto a história familiar.