ما معنى الارتباط على مستوى الجينوم؟

تعدد الأشكال أحادي النوكليوتيد (SNP) موضع تَرِد فيه قاعدتان كل منهما في $1\,\%$ من الجمهرة على الأقل؛ ونحو عشرة ملايين منها شائعة في البشر. ودراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) تحدد أنماط مئات الآلاف من مواضع SNP في آلاف من المصابين بمرض وآلاف من غير المصابين، وتسأل عند كل موضع هل يكون أحد الأليلين أكثر تواترًا في الحالات. ولأن مليون اختبار يُجرى، لا تُعتدّ النتيجة إلا دون عتبة دلالة قدرها نحو $5\times 10^{-8}$ ($0.05$ مقسومًا على المليون اختبار المستقل فعليًا). والمواضع المرتبطة تعلّم منطقة لا متغايرًا سببيًا، لأن الأليلات المتجاورة تنتقل معًا (عدم الاتزان الارتباطي) على مدى عشرات الكيلوقواعد. وفي معظم الأمراض الشائعة تزيح الأليلات المرتبطة الخطرَ بضعة في المئة وتقع في التسلسل المنظِّم غالبًا؛ وأثرها المجموع، مضافًا على آلاف المواضع بوصفه درجة متعددة المورّثات، يفسر جزءًا من التوريث ويتنبأ بالخطر تنبؤًا يقارب تنبؤ التاريخ العائلي.