¿Qué es Asociación de genoma completo?

Un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) es una posición en la que cada una de dos bases aparece en al menos el $1\,\%$ de una población; unos diez millones son frecuentes en el ser humano. Un estudio de asociación de genoma completo (GWAS) genotipa centenares de miles de SNP en miles de personas con una enfermedad y miles sin ella, y pregunta en cada SNP si un alelo es más frecuente entre los casos. Como se hace un millón de pruebas, un resultado solo cuenta por debajo de un umbral de significación de unos $5\times 10^{-8}$ ($0.05$ dividido por el millón de pruebas efectivamente independientes). Los SNP asociados señalan una región, no una variante causal, porque los alelos vecinos viajan juntos (desequilibrio de ligamiento) a lo largo de decenas de kilobases. Para la mayoría de las enfermedades comunes, cada alelo asociado desplaza el riesgo un pequeño porcentaje y se sitúa sobre todo en secuencia reguladora; su efecto conjunto, sumado sobre miles de SNP como puntuación poligénica, explica una fracción de la heredabilidad y predice el riesgo más o menos tan bien como los antecedentes familiares.