CoachLos residuos de las colas de las histonas se modifican covalentemente: acetilación de las lisinas (que neutraliza su carga positiva y afloja la sujeción del ADN), metilación de lisinas y argininas (uno, dos o tres grupos metilo, sin cambio de carga), fosforilación de serinas, ubiquitinación de lisinas. Una modificación se nombra por histona, residuo y grupo: H3K4me3 es la histona H3, lisina 4, trimetilada; H3K27ac es la H3 con la lisina 27 acetilada. El código de histonas es la correlación entre las combinaciones de marcas y el estado del gen subyacente: H3K4me3 y H3K27ac en los promotores y los potenciadores activos, H3K36me3 a lo largo de los cuerpos de los genes transcritos, H3K9me3 en la heterocromatina constitutiva, H3K27me3 en los genes silenciados durante el desarrollo. Las enzimas que añaden una marca son escritores (histona-acetiltransferasas, HAT; metiltransferasas), las que la quitan son borradores (histona-desacetilasas, HDAC; desmetilasas), y las proteínas que se unen a una marca y actúan a partir de ella son lectores: un bromodominio une acetil-lisina, y un cromodominio, metil-lisina.
Ejemplos
Ejemplo 1.11 (Números)
Los valores medidos en células de mamífero son y por división en un CpG típico. Entonces , próximo a la fracción metilada de todo el genoma, y : un sitio completamente metilado dejado a solas con la maquinaria estaría a medio camino de la media tras divisiones. Un promotor silenciado que siga silencioso durante los centenares de divisiones de una vida necesita por tanto algo más que la DNMT1: los lectores de CpG metilado reclutan metilación de H3K9 y los lectores de H3K9 reclutan a DNMT3, de manera que una isla densa de marcas eleva su propio hacia y baja el de al lado hacia . A la inversa, una célula que pierde la DNMT1 pierde la marca de forma pasiva: con la fracción de hebras metiladas se reduce a la mitad en cada división.