Biologi · Glosarium

Apa itu Modifikasi histon?

Definisi 1.4 Biologi Universitas — Tahun 3 · Bab 1 — Kromatin dan Epigenetika

Residu ekor histon dimodifikasi secara kovalen: asetilasi lisina (yang menetralkan muatan positifnya dan mengendurkan cengkeramannya pada DNA), metilasi lisina dan arginina (satu, dua, atau tiga gugus metil, tanpa perubahan muatan), fosforilasi serina, ubikuitinasi lisina. Sebuah modifikasi dinamai menurut histon, residu, dan gugusnya: H3K4me3 adalah histon H3, lisina 4, termetilasi tiga kali; H3K27ac adalah H3 lisina 27 terasetilasi. Yang disebut sandi histon adalah keterkaitan antara gabungan tanda dan keadaan gen di bawahnya: H3K4me3 dan H3K27ac pada promotor dan penguat yang aktif, H3K36me3 sepanjang tubuh gen yang ditranskripsi, H3K9me3 pada heterokromatin konstitutif, H3K27me3 pada gen yang dibungkam selama perkembangan. Enzim yang menambahkan tanda disebut penulis (histon asetiltransferase, HAT; metiltransferase), enzim yang membuangnya disebut penghapus (histon deasetilase, HDAC; demetilase), dan protein yang mengikat sebuah tanda lalu bertindak atasnya disebut pembaca: sebuah bromodomain mengikat asetil-lisina, sebuah kromodomain mengikat metil-lisina.

Contoh

Contoh 1.11 (Angka-angkanya)

Nilai terukur bagi sel mamalia adalah μ0.99\mu \approx 0.99 dan δ0.02\delta \approx 0.02 tiap pembelahan pada CpG yang lazim. Maka p=0.02/0.030.67p^{*} = 0.02/0.03 \approx 0.67, dekat dengan fraksi termetilasi seluruh genom, dan μδ=0.97\mu - \delta = 0.97: tapak yang termetilasi penuh lalu dibiarkan pada permesinannya saja akan berada separuh jalan kembali ke rata-rata sesudah ln2/0.0323\ln 2 / 0.03 \approx 23 pembelahan. Promotor yang dibungkam dan tetap bisu selama ratusan pembelahan seumur hidup karena itu menuntut lebih daripada DNMT1: pembaca metil-CpG merekrut metilasi H3K9 dan pembaca H3K9 merekrut DNMT3, sehingga pulau tanda yang rapat menaikkan μ\mu-nya sendiri menuju 11 dan menurunkan δ\delta tetangganya menuju 00. Sebaliknya, sel yang kehilangan DNMT1 kehilangan tandanya secara pasif: dengan μ=δ=0\mu = \delta = 0 fraksi untai yang termetilasi separuh pada tiap pembelahan.

Baca dalam konteks →