Un cil ou un flagelle d’eucaryote est une extension couverte de membrane bâtie sur l’axonème : neuf doublets de microtubules en anneau autour d’une paire centrale, tenus par des liens de nexine et des bras radiaires, et poussée depuis un corpuscule basal, centriole modifié. Les dynéines axonémales fixées à chaque doublet marchent le long du doublet voisin vers son extrémité moins, à la base ; comme les doublets sont attachés entre eux ils ne peuvent pas glisser librement, et le glissement est converti en courbure, propagée le long de l’axonème comme une onde par le passage des dynéines actives d’un côté de l’anneau à l’autre. Un cil mesure et bat fois par seconde ; un flagelle de spermatozoïde fait et ondule. Les protéines d’un cil sont montées depuis le corps cellulaire par la kinésine-2 et redescendues par la dynéine-2 le long des doublets : le transport intraflagellaire, qui est aussi la façon dont se bâtit un cil primaire immobile — présent, un par cellule, sur la plupart des cellules de vertébré ; ce cil est une antenne sensorielle, qui loge les récepteurs de la lumière (le segment externe d’un bâtonnet), des odeurs, de l’écoulement et des signaux du développement, et dont les défauts causent les ciliopathies : reins polykystiques, dégénérescence rétinienne, obésité, doigts surnuméraires.