RNA व्यवधान (RNAi) द्विलड़ी RNA से बने किसी छोटे RNA द्वारा किसी जीन का अनुक्रम-विशिष्ट मौनीकरण है। एंज़ाइम डाइसर, एक RNase III, लंबे द्विलड़ी RNA को -न्यूक्लियोटाइड के ऐसे युग्मकों में काटती है जिनके 3 सिरों पर दो-न्यूक्लियोटाइड के अधिलंब हैं; हर युग्मक की एक लड़ी, मार्गदर्शक, किसी आर्गोनॉट प्रोटीन में भरी जाती है और RNA-प्रेरित मौनीकरण संकुल (RISC) बनता है। मार्गदर्शक किसी पूरक लक्ष्य RNA से युग्मित होता है, और आर्गोनॉट का एंडोन्यूक्लिएज़ प्रांत लक्ष्य को मार्गदर्शक के न्यूक्लियोटाइड 10 तथा 11 के सामने काट देता है; कटा RNA फिर अपघटित होता है और RISC मुक्त होकर कोई दूसरा ढूँढ़ता है। पौधों, कृमियों और कवकों में एक RNA-निर्भर RNA पॉलीमरेज़ लक्ष्य की नकल करके नया द्विलड़ी RNA बनाती है, जिससे संकेत प्रवर्धित होकर फैलता है; स्तनधारियों में यह चरण नहीं है।