Interferensi RNA (RNAi) adalah pembungkaman sebuah gen yang khas urutan oleh RNA kecil yang berasal dari RNA beruntai ganda. Enzim Dicer, sebuah RNase III, memotong RNA beruntai ganda yang panjang menjadi duplek sepanjang nukleotida dengan tonjolan 3 sepanjang dua nukleotida; salah satu untai tiap duplek, yaitu pemandunya, dimuatkan ke dalam protein Argonaute sehingga membentuk kompleks pembungkam terimbas RNA (RISC). Pemandunya berpasangan dengan RNA sasaran yang komplementer, dan domain endonuklease Argonaute memotong sasarannya berhadapan dengan nukleotida 10 dan 11 pemandunya; RNA yang terpotong lalu diuraikan dan RISC-nya dilepaskan untuk mencari sasaran lain. Pada tumbuhan, cacing, dan fungi sebuah RNA polimerase bergantung-RNA menyalin sasarannya menjadi RNA beruntai ganda yang baru, sehingga isyaratnya diperkuat dan menyebar; mamalia tidak memiliki langkah ini.