Biologie · Begrippenlijst

Wat is Translesiesynthese?

Definitie 3.10 Universitaire biologie — jaar 3 · Hoofdstuk 3 — Genoomstabiliteit: DNA-schade, herstel en recombinatie

Wanneer een vork een laesie tegenkomt die niet is hersteld, strandt het replicatieve polymerase. De translesiesynthese (TLS) roept een gespecialiseerd polymerase met een ruimere actieve plaats en zonder proeflezen erbij — Pol η\eta voor pyrimidinedimeren, Pol ι\iota, κ\kappa, ζ\zeta en Rev1 voor andere laesies — dat enkele nucleotiden tegenover de laesie zet en daarna opzij gaat. Pol η\eta zet twee adenines tegenover een thyminedimeer, wat meestal juist is; de andere zitten er vaak naast. TLS ruilt nauwkeurigheid in voor het voortbestaan van de vork, en is de bron van de meeste mutaties die ultraviolet licht veroorzaakt. De variantvorm van xeroderma pigmentosum (XP-V) heeft een intact excisieherstel en mist Pol η\eta: de dimeren die aan de excisie ontsnappen worden door de foutgevoeliger polymerasen overbrugd, en de kankers volgen.

Voorbeelden

Voorbeeld 3.9 (Waarom xeroderma een ziekte van de vork is)

Een dosis zon laat N=105N = 10^{5} pyrimidinedimeren in een keratinocyt achter. Met een halveringstijd van het nucleotide-excisieherstel van 2h2\,\mathrm{h} (k=0.35h1k = 0.35\,\mathrm{h}^{-1}) en een vork die na 8h8\,\mathrm{h} aankomt, zijn er NekT=105×e2.86000N e^{-kT} = 10^{5}\times e^{-2.8} \approx 6000 dimeren over om te worden gekopieerd; met het vrijwel afwezige herstel van een XP-cel (k0.01h1k \approx 0.01\,\mathrm{h}^{-1}) zijn dat er 9200092\,000. Elke dimeer die de vork tegenkomt wordt overbrugd door translesiesynthese (hieronder), die foutgevoelig is: de mutatielast per deling van de patiënt is vijftien keer de normale, en de huidkankers volgen al in de kindertijd. De remedie die werkt is NN klein houden — ultraviolet licht volledig mijden.

Lees in het hoofdstuk →