Biologia · Glossário

O que é Diversidade?

Definição 14.4 Biologia universitária — 3.º ano · Capítulo 14 — Microbiomas e simbioses

Para uma comunidade de SS espécies com abundâncias relativas p1,,pSp_{1},\dots, p_{S} (pi=1\sum p_{i} = 1): a riqueza é SS; o índice de Shannon H=ipilnpiH = -\sum_{i} p_{i}\ln p_{i} mede a incerteza sobre a espécie de um indivíduo sorteado ao acaso, e eHe^{H} é o número de espécies igualmente abundantes que daria a mesma incerteza (o número efetivo de espécies); o índice de Simpson D=ipi2D = \sum_{i} p_{i}^{2} é a probabilidade de dois indivíduos sorteados ao acaso serem da mesma espécie, e 1/D1/D é outro número efetivo, ponderado a favor das espécies comuns. A riqueza depende de quantos indivíduos se examinou: uma curva de rarefação representa as espécies encontradas contra o número de indivíduos amostrados, e se achata quando a maioria das espécies já foi vista.

Exemplos

Exemplo 14.6 (Dois intestinos)

Uma amostra de 10001000 leituras de uma pessoa dá 150150 espécies, com H=3.5H = 3.5 e 4040 singletons; uma amostra de 50005000 leituras de outra dá 260260 espécies. A segunda não é necessariamente mais diversa: ela foi amostrada cinco vezes mais a fundo, e rarefazê-la a 10001000 leituras pode dar 150150 também. A cobertura da primeira amostra é 140/1000=96%1 - 40/1000 = 96\,\%: quatro por cento das bactérias daquele intestino pertencem a espécies que a amostra nunca viu, e uma amostra mais profunda as encontrará. Os números efetivos — e3.533e^{3.5} \approx 33 espécies em equitatividade contra uma riqueza de 150150 — dizem que umas poucas espécies dominam, que é como todo intestino se apresenta.

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