Un eucariota unicelular se alimenta de una de tres maneras, o de dos a la vez. Fototrofia: tiene cloroplastos y fabrica su propia materia orgánica a partir de la luz y el (algas verdes, diatomeas, dinoflagelados). Fagotrofia: engloba partículas — bacterias, otros protistas — en una vacuola digestiva donde las enzimas lisosómicas las digieren (amebas, ciliados, coanoflagelados). Osmotrofia: absorbe moléculas disueltas a través de su membrana, a menudo tras secretar enzimas al exterior (levaduras, muchos parásitos). Los mixótrofos, como Euglena, hacen la fotosíntesis a la luz y comen en la oscuridad. Los procariotas no pueden fagocitar: la pared se lo impide, y por eso ningún procariota llegó a ser un depredador que engloba a sus presas.
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