Le fractionnement cellulaire sépare les constituants d’une cellule pour les étudier. Le tissu est homogénéisé — les cellules sont ouvertes dans un tampon froid et isotonique, par broyage ou cisaillement, ce qui laisse les organites intacts — et l’homogénat est soumis à une centrifugation différentielle : une série de tours de force et de durée croissantes, dont chacun sédimente les particules les plus grosses et les plus denses restant en suspension. Chaque fraction est identifiée par son aspect au microscope électronique et par des enzymes marqueurs, activités connues pour ne résider que dans un seul compartiment.