कोशिका प्रभाजन अध्ययन के लिए किसी कोशिका के घटक अलग करता है। ऊतक को समांगीकृत किया जाता है — यानी कोशिकाएँ किसी ठंडे, समपरासरी बफ़र में पीसकर या कतरकर खोली जाती हैं, और कोशिकांग बचे रहते हैं — और उस समांगक पर अवकल अपकेंद्रण किया जाता है: यानी बढ़ते बल और बढ़ती अवधि के चक्करों की एक शृंखला, जिनमें से हर चक्कर निलंबन में बचे सबसे बड़े और सबसे सघन कणों को तल पर बिठा देता है। हर प्रभाग की पहचान इलेक्ट्रॉन सूक्ष्मदर्शी के नीचे उसकी शक्ल से और सूचक एंजाइमों से होती है, यानी उन क्रियाओं से जिनके बारे में ज्ञात है कि वे केवल एक ही कक्ष में रहती हैं।