Deux organes de deux espèces sont homologues lorsqu’ils ont la même structure et la même position dans le plan d’organisation — bâtis des mêmes parties dans les mêmes rapports — quelle que soit leur fonction actuelle. Les membres antérieurs des tétrapodes en sont l’exemple type : un os (l’humérus), deux os (le radius et l’ulna), un groupe d’os du carpe, puis les doigts. Des organes qui remplissent la même fonction avec une structure différente — l’aile d’un oiseau et l’aile d’une mouche — sont seulement analogues, et ne disent rien de la parenté.