अपघटन मृत कार्बनिक पदार्थ (कर्कट, मृत लकड़ी, शव, गोबर) का अपरदभक्षियों और अपघटकों द्वारा कार्बन डाइऑक्साइड, जल तथा खनिज आयनों में टूटना है — यही खनिजीकरण है। उसकी दर तापमान, नमी, ऑक्सीजन और कर्कट की गुणवत्ता (नाइट्रोजन की मात्रा, लिग्निन) पर निर्भर करती है: कोई पत्ता किसी गरम नम वन में एक साल में लुप्त हो जाता है, किसी ठंडी ढलान पर शंकुधारियों के नीचे एक दशक में, और किसी दलदल में सहस्राब्दियों में। छूटे खनिज आयन जड़ें और सूक्ष्मजीव फिर से ले लेते हैं, और किसी परिपक्व पारितंत्र में यही आंतरिक चक्र अधिकांश पोषक-बहाव ढोता है: अपक्षय तथा वर्षा से आया निवेश और धारा के जल में गया निर्गम उसके आगे छोटे हैं। कोई पोषक-बजट किसी परिभाषित पारितंत्र के लिए किसी एक तत्व के निवेश, निर्गम और आंतरिक कोषों की तुलना करता है; ग्रह के पैमाने पर जैव-भू-रासायनिक चक्र वर्ष 2 के खंड में लिए जाते हैं।