Tentang Pelatih Masuk Mulai membaca

Biologi · Glosarium

Apa itu Virus?

Definisi 17.11 Biologi Universitas — Tahun 1 · Bab 17 — Genom Sel dan Virus

Yang disebut virus adalah sebuah genom dalam sebuah cangkang protein, yaitu kapsid — kadang terbungkus sebuah membran, yaitu selubung, yang diambil dari sebuah sel inang — yang berbiak hanya di dalam sebuah sel, dengan memakai ribosom, energi dan prazat sel itu. Genomnya dapat berupa DNA atau RNA, berutas ganda atau tunggal, lurus atau melingkar, satu molekul atau beberapa: dari 5 kb5\,\mathrm{kb} (beberapa gen) sampai 1.2 Mb1.2\,\mathrm{Mb} (seribu gen, pada virus raksasa). Di luar sebuah sel sebuah virus tidak berbuat apa-apa: ia bukan sel, tidak bermetabolisme, dan hidup hanya dalam arti bahwa ia membawa informasi dan berevolusi. Bakteriofag adalah virus bakteri.

Bakteriofag yang melekat pada sebuah bakteri: kepala bersegi banyak yang memegang DNA-nya, ekor yang akan menjadi jalan penyuntikannya. Satu sel akan melepas seratus fag baru dalam setengah jam.
Bakteriofag yang melekat pada sebuah bakteri: kepala bersegi banyak yang memegang DNA-nya, ekor yang akan menjadi jalan penyuntikannya. Satu sel akan melepas seratus fag baru dalam setengah jam.

Contoh

Contoh 17.13 (Virus bergenom RNA)

Influenza membawa delapan ruas RNA berutas tunggal beserta polimerasenya sendiri untuk menyalinnya, sebab sel tidak memiliki enzim yang menyalin RNA; polimerasenya membuat satu kekeliruan tiap 10 00010\,000 basa dan virusnya berubah tiap musim. Sebuah retrovirus (HIV) membawa RNA dan sebuah transkriptase balik yang menyalinnya menjadi DNA, yang disisipkan ke dalam kromosom inangnya seperti sebuah profag — sebuah infeksi yang menetap. Mekanismenya, dan tanggapan kekebalan terhadapnya, menjadi bagian jilid Tahun ke-3; di sini keduanya menandai rentang apa yang dapat menjadi sebuah genom.

Baca dalam konteks →
Definisi 13.1 Biologi Universitas — Tahun 3 · Bab 13 — Virologi

Sebuah virus adalah parasit intrasel obligat yang terdiri atas sebuah genom asam nukleat — DNA atau RNA, untai tunggal atau untai ganda, lurus atau melingkar, satu molekul atau beberapa — yang terkemas di dalam sebuah kapsid protein, dan dalam banyak hal terbungkus sebuah selubung yang diambil dari membran inang serta bertaburan glikoprotein virus. Partikel menular yang lengkap adalah virion, yang bagi kebanyakannya berukuran 20 sampai 300 nm20\text{ sampai }300\,\mathrm{nm} (beberapa virus raksasa mencapai satu mikrometer). Kapsid dibangun dari banyak salinan satu atau beberapa protein yang tersusun dengan simetri heliks (sebuah batang, seperti pada virus mosaik tembakau) atau simetri ikosahedral (sebuah cangkang beranggota 60T60T subunit, dengan T=1,3,4,7,…T = 1, 3, 4, 7,\dots). Klasifikasi Baltimore menggolongkan virus menurut jalan dari genom ke RNA duta: I, DNA untai ganda (herpes, cacar, adenovirus, sebagian besar fag); II, DNA untai tunggal (parvovirus); III, RNA untai ganda (rotavirus); IV, RNA untai positif, yang dirinya sendiri sebuah duta (polio, hepatitis C, koronavirus); V, RNA untai negatif, yang komplemen terhadap duta (influenza, campak, rabies, Ebola); VI, RNA yang ditranskripsi balik menjadi DNA (retrovirus, HIV); VII, DNA yang digandakan lewat sebuah antara RNA (hepatitis B). Setiap kelas selain I harus membawa atau menyandi sebuah enzim yang tidak dipunyai sel — sebuah RNA polimerase bergantung-RNA, sebuah transkriptase balik — dan enzim itulah sasaran kebanyakan obat antivirus.

Contoh

Contoh 13.6 (HIV sebelum dan sesudah persamaannya)

Sampai tahun 1995 tahun-tahun latensi klinis infeksi HIV — muatan virus yang mantap sebesar 10410^{4}–10610^{6} salinan per mililiter dan penurunan lambat sel T — dibaca sebagai virus yang lelap. Ho, Perelson, dan rekannya memberi pasien sebuah penghambat protease lalu mencocokkan penurunan muatan virus itu dengan teoremanya: fase cepatnya memberi c≈3 d−1c \approx 3\,\mathrm{d}^{-1} (paruh hidup virion sekitar enam jam), fase lambatnya δ≈0.5 d−1\delta \approx 0.5\,\mathrm{d}^{-1} (sebuah sel terinfeksi hidup sekitar satu setengah hari). Muatan mantap sebesar 10510^{5} per mililiter di dalam 15 L15\,\mathrm{L} cairan tubuh, yang disingkirkan dengan laju cc, karena itu menuntut produksi sekitar 101010^{10} virion sehari, tiap hari, bertahun-tahun: masa “laten” itu adalah keadaan mantap infeksi dan kematian yang garang, dengan kumpulan sel T tergantikan tiap hari sampai ia gagal. Aritmetika mutasi pada bagian berikutnya lalu menyusul seketika, dan bersamanya alasan mengapa obat tunggal gagal sementara tiga obat tidak.

Contoh 13.9 (Mengapa HIV memerlukan tiga obat)

Transkriptase balik HIV keliru sekitar sekali tiap 10510^{5} nukleotida, sehingga tiap genom 9700 nt9700\,\mathrm{nt} yang disalin mengusung sekitar 0.10.1 mutasi, dan 101010^{10} genom baru sehari mengusung 10910^{9} mutasi di antaranya: tiap satu dari 3×9700≈30 0003\times 9700 \approx 30\,000 mutasi titik tunggal yang mungkin muncul berkali-kali setiap hari, sebelum obat apa pun diberikan. Sebuah obat yang dikalahkan satu mutasi — sebagaimana satu mutasi mengalahkan kebanyakan penghambat transkriptase balik dan penghambat protease — karena itu dikalahkan dalam hitungan minggu, dan itulah yang menimpa AZT pada tahun 1987. Dua mutasi yang saling bebas muncul bersama pada 10−1010^{-10} per genom, sekitar sekali sehari; tiga mutasi pada 10−1510^{-15}, sekali tiap seribu hari — dan seorang pasien dengan tiga obat yang muatannya telah turun seribu kali lipat menghasilkan 10710^{7} genom sehari, sehingga mutan rangkap tiga itu tidak pernah muncul. Hal itu, dan pembuktian teoremanya bahwa virusnya sedang menggandakan diri dengan kecepatan penuh, menjadikan terapi gabungan sejak tahun 1996 pengobatan yang mengubah AIDS menjadi sebuah keadaan menahun.

Baca dalam konteks →

Istilah terkait