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Biologia · Glossário

O que é Nucleotídeo?

Também chamado de: base (DNA) · base nitrogenada · purina · pirimidina

Definição 3.4 Biologia do ensino médio · Capítulo 3 — O DNA: uma molécula genética universal

O DNA é uma cadeia de nucleotídeos. Cada nucleotídeo é feito de três partes: um grupo fosfato, um açúcar (a desoxirribose) e uma de quatro bases nitrogenadas: adenina (A), timina (T), guanina (G) e citosina (C). Açúcares e fosfatos se alternam para formar o esqueleto da cadeia; as bases se projetam dele, uma por nucleotídeo. Os quatro nucleotídeos diferem só pela base, de modo que uma fita de DNA é descrita pela sequência das bases dela, escrita como uma sequência de letras: ATGGCTTAC…

As duas fitas do DNA, desenhadas planas. Cada fita é uma cadeia de nucleotídeos (fosfato, açúcar, base). As fitas correm em sentidos opostos e são mantidas juntas por pares de bases: A sempre fica diante de T, G sempre diante de C. Um par de bases segue o seguinte a cada 0.34\, nm.
As duas fitas do DNA, desenhadas planas. Cada fita é uma cadeia de nucleotídeos (fosfato, açúcar, base). As fitas correm em sentidos opostos e são mantidas juntas por pares de bases: A sempre fica diante de T, G sempre diante de C. Um par de bases segue o seguinte a cada 0.34 nm0.34\,\mathrm{nm}.
Composição em bases do DNA de quatro espécies. Em cada uma, as barras de A e de T coincidem e as de G e de C coincidem — a assinatura do pareamento de bases —, enquanto a parcela de A+T difere de uma espécie para outra.
Composição em bases do DNA de quatro espécies. Em cada uma, as barras de A e de T coincidem e as de G e de C coincidem — a assinatura do pareamento de bases —, enquanto a parcela de A+T difere de uma espécie para outra.

Exemplos

Exemplo 3.6 (A regra de Chargaff em números)

DNA humano: A 30.9%, T 29.4%, G 19.9%, C 19.8% — A ≈ \,\approx\,T e G ≈ \,\approx\,C dentro da precisão da medida, e A+T =60%= 60\%. E. coli: A 24.7%, T 23.6%, G 26.0%, C 25.7%, A+T =48%= 48\%. Levedura: A+T =64%= 64\%. Se uma amostra de DNA contém 32% de A, a complementaridade prevê 32% de T e (100−64)/2=18%(100 - 64)/2 = 18\% de G e de C.

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Definição 11.1 Biologia universitária — 1.º ano · Capítulo 11 — Nucleotídeos e ácidos nucleicos

Um nucleotídeo é feito de três partes: uma base nitrogenada — uma purina (adenina A, guanina G: dois anéis fundidos) ou uma pirimidina (citosina C, timina T, uracila U: um anel); um açúcar de cinco carbonos, a ribose no RNA ou a 2′'-desoxirribose no DNA (sem a hidroxila do carbono 2′2'); e de um a três grupos fosfato no carbono 5′5' do açúcar. A base é ligada ao carbono 1′1'; os carbonos do açúcar são numerados com linhas para distingui-los dos da base. Base mais açúcar formam um nucleosídeo (adenosina, guanosina, citidina, timidina, uridina); com fosfatos, um nucleotídeo (AMP, ADP, ATP e os parentes deles).

As partes de um nucleotídeo: uma base no carbono 1' de uma pentose, fosfatos no carbono 5'. A hidroxila 3' é onde o nucleotídeo seguinte de uma cadeia vai se ligar; a posição 2' distingue o RNA (OH) do DNA (H).
As partes de um nucleotídeo: uma base no carbono 1′1' de uma pentose, fosfatos no carbono 5′5'. A hidroxila 3′3' é onde o nucleotídeo seguinte de uma cadeia vai se ligar; a posição 2′2' distingue o RNA (OH) do DNA (H).

Exemplos

Exemplo 11.4 (O RNA é frágil, o DNA é durável)

A hidroxila 2′2' da ribose pode atacar a ligação fosfodiéster vizinha: em álcali brando o RNA é hidrolisado a nucleotídeos em poucas horas, ao passo que o DNA, que não tem essa hidroxila, sobrevive à fervura em álcali e já foi recuperado intacto de ossos com dezenas de milhares de anos. A uracila do RNA é a timina sem o grupo metila; o DNA usa timina para que a citosina, que lentamente perde o grupo amino e vira uracila, possa ser reconhecida como danificada e reparada — uma uracila no DNA é sempre um erro.

Exemplo 11.7 (Ler uma fita)

Se uma fita lê 5′5'-ATGGCATTC-3′3', a parceira dela, escrita de 5′→3′5' \to 3', é 5′5'-GAATGCCAT-3′3': complemente cada base e depois inverta a ordem. Nove pares, 3.1 nm3.1\,\mathrm{nm} de hélice, vinte e duas ligações de hidrogênio (cinco G–C, quatro A–T). Um cromossomo humano de 2.5×1082.5 \times 10^{8} pares tem 8.5 cm8.5\,\mathrm{cm} de comprimento nessa forma e precisa ser dobrado cem mil vezes para caber num núcleo (Capítulo 17).

Exemplo 11.11 (Uma sonda encontra um gene)

Uma sonda de vinte nucleotídeos complementar a um gene, a 5 ∘C5\,{}^{\circ}\mathrm{C} abaixo do TmT_m dela, liga-se à complementar exata dela e a mais nada em três bilhões de pares de bases: um único descasamento em vinte baixa o TmT_m em vários graus e o híbrido descasado funde. A especificidade do pareamento de bases, multiplicada por vinte posições, é aquilo em que se apoia todo teste de DNA, do exame de paternidade à detecção de patógenos.

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