O que é Reconhecimento de padrões?

As células inatas reconhecem padrões moleculares associados a patógenos (PAMPs): moléculas comuns a classes inteiras de micróbios, essenciais para eles e ausentes no hospedeiro — o lipopolissacarídeo das paredes Gram-negativas, o peptidoglicano e o ácido lipoteicoico das Gram-positivas, a flagelina, os $\beta$-glicanos fúngicos, o RNA de fita dupla, o RNA sem capuz 5$'$, o DNA com CpG não metilado, o DNA no citosol. Os receptores são os receptores de reconhecimento de padrões (PRRs), algumas dezenas ao todo, cada um codificado por um gene: os receptores do tipo Toll (TLRs) na superfície e nos endossomos (TLR4 para o lipopolissacarídeo, TLR5 para a flagelina, TLR3 para o RNA de fita dupla, TLR9 para o DNA CpG); as proteínas citosólicas NOD para fragmentos de peptidoglicano, RIG-I para o RNA viral, cGAS–STING para o DNA citosólico; as lectinas do tipo C para os açúcares fúngicos. Os mesmos receptores, ou outros das mesmas famílias, reconhecem padrões moleculares associados a danos (DAMPs) liberados por células lesadas — ATP, ácido úrico, a proteína nuclear HMGB1, DNA mitocondrial —, de modo que uma lesão estéril também inflama. A ligação ativa os fatores de transcrição NF-$\kappa$B e os fatores reguladores de interferon, que ligam citocinas, quimiocinas, moléculas de adesão e genes antimicrobianos em menos de uma hora; um subconjunto dos sensores citosólicos monta o inflamassomo, uma plataforma que ativa a caspase-1 para cortar a interleucina-1$\beta$ em sua forma ativa e disparar a morte inflamatória chamada piroptose (Capítulo 10).