¿Qué es Reconocimiento de patrones?

Las células innatas reconocen patrones moleculares asociados a patógenos (PAMP): moléculas comunes a clases enteras de microbios, esenciales para ellos y ausentes del hospedador — el lipopolisacárido de las paredes gramnegativas, el peptidoglicano y el ácido lipoteicoico de las grampositivas, la flagelina, los $\beta$-glucanos de los hongos, el ARN de doble hebra, el ARN sin caperuza 5$'$, el ADN con CpG sin metilar, el ADN en el citosol. Los receptores son receptores de reconocimiento de patrones (PRR), unas pocas decenas en total, codificados cada uno por un gen: los receptores de tipo Toll (TLR) de la superficie y de los endosomas (TLR4 para el lipopolisacárido, TLR5 para la flagelina, TLR3 para el ARN de doble hebra, TLR9 para el ADN con CpG); las proteínas NOD citosólicas para los fragmentos de peptidoglicano, RIG-I para el ARN vírico, cGAS–STING para el ADN citosólico; las lectinas de tipo C para los azúcares fúngicos. Esos mismos receptores, u otros de las mismas familias, reconocen los patrones moleculares asociados a daño (DAMP) que liberan las células lesionadas — ATP, ácido úrico, la proteína nuclear HMGB1, ADN mitocondrial —, de modo que una lesión estéril también inflama. La unión activa el factor de transcripción NF-$\kappa$B y los factores reguladores del interferón, que en menos de una hora encienden citocinas, quimiocinas, moléculas de adhesión y genes antimicrobianos; y un subconjunto de los sensores citosólicos ensambla el inflamasoma, una plataforma que activa la caspasa-1 para cortar la interleucina-1$\beta$ y darle su forma activa y para desencadenar la muerte inflamatoria llamada piroptosis (Capítulo 10).