Apa itu Pengenalan pola?

Sel bawaan mengenali pola molekul terkait patogen (PAMP): molekul yang lazim pada seluruh kelas mikroba, yang penting bagi mereka, dan yang tidak ada pada inangnya — lipopolisakarida dinding Gram-negatif, peptidoglikan dan asam lipoteikoat pada Gram-positif, flagelin, $\beta$-glukan jamur, RNA untai ganda, RNA tanpa tudung 5$'$, DNA dengan CpG tak termetilasi, DNA di dalam sitosol. Reseptornya adalah reseptor pengenal pola (PRR), beberapa lusin saja seluruhnya, masing-masing disandi satu gen: reseptor serupa Toll (TLR) pada permukaan dan di dalam endosom (TLR4 bagi lipopolisakarida, TLR5 bagi flagelin, TLR3 bagi RNA untai ganda, TLR9 bagi DNA CpG); protein NOD sitosolik bagi serpihan peptidoglikan, RIG-I bagi RNA virus, cGAS–STING bagi DNA sitosolik; lektin jenis C bagi gula jamur. Reseptor yang sama, atau reseptor lain dari keluarga yang sama, mengenali pola molekul terkait kerusakan (DAMP) yang dilepaskan oleh sel yang terluka — ATP, asam urat, protein inti HMGB1, dan DNA mitokondria — sehingga cedera steril pun meradang. Pengikatannya mengaktifkan faktor transkripsi NF-$\kappa$B dan faktor pengatur interferon, yang menyalakan sitokin, kemokin, molekul pelekat, dan gen antimikroba dalam sejam; sebagian pengindera sitosolik merakit inflamasom, yakni sebuah landasan yang mengaktifkan kaspase-1 untuk memotong interleukin-1$\beta$ menjadi bentuk aktifnya lalu memicu kematian meradang yang disebut piroptosis (Bab 10).