تسلسل سانغر ينسخ قالبًا مفرد الطاق انطلاقًا من بادئة ببوليميراز DNA بحضور النوكليوتيدات الأربعة السوية ونسبة صغيرة من النوكليوتيدات ثنائية منزوعة الأكسجين، التي تنقصها الهيدروكسيل 3 فتنهي السلسلة حيثما أُدخلت. ويحمل كل نوكليوتيد ثنائي منزوع الأكسجين صبغًا متألقًا مختلفًا. والناتج مزيج من القطع، قطعة لكل موضع من القالب، تنتهي كل منها بقاعدة معلومة الهوية؛ فإذا فُصلت بالحجم في شعيرة من هلام، مرّت بكاشف مرتبةً بالطول، وكان تسلسل الألوان هو تسلسل القالب. ويقرأ الشوط الواحد بمعدل خطأ دون ؛ وهو ما يزال الطريقة المعتمدة للتحقق من بنية مركّبة أو من مورّثة واحدة.