Biologie · Glossaire

Qu'est-ce que « Séquençage par terminaison de chaîne » ?

Définition 4.1 Biologie universitaire — 3e année · Chapitre 4 — Génomique et séquençage

Le séquençage de Sanger recopie une matrice simple brin à partir d’une amorce, avec une ADN polymérase, en présence des quatre nucléotides normaux et d’une petite proportion de didésoxynucléotides, dépourvus de l’hydroxyle 3' et qui terminent donc la chaîne partout où ils sont incorporés. Chaque didésoxynucléotide porte un fluorophore différent. Le produit est un mélange de fragments, un pour chaque position de la matrice, se terminant chacun par une base d’identité connue ; séparés par la taille dans un capillaire de gel, ils passent devant un détecteur par ordre de longueur, et la suite des couleurs est la séquence de la matrice. Une course lit 700 aˋ 900bp700\text{ à }900\,\mathrm{bp} avec un taux d’erreur inférieur à 10310^{-3} ; elle reste la méthode pour vérifier une construction ou un gène isolé.

À gauche : Frederick Sanger, qui a mis au point les premières méthodes praticables de lecture des protéines et de l’ADN et a reçu un prix Nobel pour chacune. À droite : l’autoradiographie d’un gel de séquençage d’avant l’ère des capillaires, une piste par base, la séquence se lisant de bas en haut sur l’échelle de bandes. À gauche : Frederick Sanger, qui a mis au point les premières méthodes praticables de lecture des protéines et de l’ADN et a reçu un prix Nobel pour chacune. À droite : l’autoradiographie d’un gel de séquençage d’avant l’ère des capillaires, une piste par base, la séquence se lisant de bas en haut sur l’échelle de bandes.
À gauche : Frederick Sanger, qui a mis au point les premières méthodes praticables de lecture des protéines et de l’ADN et a reçu un prix Nobel pour chacune. À droite : l’autoradiographie d’un gel de séquençage d’avant l’ère des capillaires, une piste par base, la séquence se lisant de bas en haut sur l’échelle de bandes.
Séquençage par terminaison de chaîne. Une base didésoxy achève la copie à chaque position où elle est incorporée ; les fragments, un par longueur, sont séparés par la taille et la couleur de chaque base terminale se lit dans l’ordre.
Séquençage par terminaison de chaîne. Une base didésoxy achève la copie à chaque position où elle est incorporée ; les fragments, un par longueur, sont séparés par la taille et la couleur de chaque base terminale se lit dans l’ordre.
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