Dans un noyau eucaryote, l’ADN est enroulé sur des protéines : paires de bases font 1.7 tour autour d’un octamère de huit histones (deux de chacune des H2A, H2B, H3, H4, petites protéines riches en lysine et en arginine qui neutralisent les phosphates), ce qui forme un nucléosome de ; les nucléosomes se suivent toutes les paires environ, comme des perles sur un fil, une cinquième histone, H1, scellant chaque perle. Cette chromatine se replie encore : en une fibre de , en boucles de plusieurs dizaines de milliers de paires ancrées sur une charpente protéique, et — à la division — en bâtonnets compacts du chromosome métaphasique, dix mille fois plus courts que l’ADN nu. L’euchromatine est la forme lâche, riche en gènes et transcrite de l’interphase ; l’hétérochromatine la forme condensée, pauvre en gènes, qui reste compacte (autour des centromères, aux extrémités, et sur un chromosome X éteint).

