Num núcleo eucariótico o DNA está enrolado em proteínas: pares de bases dão 1.7 volta em torno de um octâmero de oito histonas (duas de cada uma das H2A, H2B, H3 e H4, proteínas pequenas ricas em lisina e arginina que neutralizam os fosfatos), formando um nucleossomo de de diâmetro; os nucleossomos se seguem uns aos outros a cada pares, mais ou menos, como contas num colar, com uma quinta histona, a H1, selando cada conta. Essa cromatina se dobra ainda mais: numa fibra de , em alças de dezenas de milhares de pares ancoradas num arcabouço proteico e — na divisão — nos bastões compactos do cromossomo metafásico, dez mil vezes mais curtos que o DNA nu. A eucromatina é a forma mais frouxa, rica em genes e transcrita da interfase; a heterocromatina, a forma condensada e pobre em genes que permanece compacta (em torno dos centrômeros, nas extremidades e num cromossomo X desligado).

