द्विगुणन, कुल और अंतरण क्या है?

अधिकांश नए जीन पुरानों की प्रतियाँ हैं। कोई जीन-द्विगुणन — असमान विनिमय से, प्रतिलोम-स्थानांतरण से, या पूरे जीनोम के दुगुने होने से, जैसा कशेरुकियों के उद्गम पर दो बार हुआ और फिर अस्थिमीनों के पूर्वज में तथा अनेक पादप वंश-परंपराओं में — वहाँ दो पैरालॉग छोड़ जाता है जहाँ एक था; और भिन्न जातियों के वे जीन जो किसी एक ही पुरखा जीन से उतरे हों ऑर्थोलॉग हैं। उस प्रति का आम भवितव्य क्षय है: बंधन से छूटकर ($\omega \to 1$) वह कोई विराम-कूटक या कोई खाँचा-खिसकाव जमा कर लेती है और कोई आभासी जीन बन जाती है, जिनमें से मानव जीनोम कोई बीस हज़ार ढोता है। कभी-कभी दोनों बच जाते हैं: नव-प्रकार्यन से, जिसमें कोई एक प्रति कोई नया प्रकार्य पा लेती है जबकि दूसरी पुराना रखे रहती है (हिममीन का प्रति-हिम ग्लाइकोप्रोटीन, किसी ट्रिप्सिनोजन जीन से; नरवानरों के लाल तथा हरे ऑप्सिन, चार करोड़ वर्ष पहले के उस द्विगुणन से जिसने वह त्रिवर्णी दृष्टि दी जिसका वर्णन वर्ष 1 के खंड ने किया; और नेत्रोद क्रिस्टलिन, उपापचयी एंज़ाइमों से); या उप-प्रकार्यन से, जिसमें हर प्रति उस पुरखे की अभिव्यक्ति या क्रियाशीलता का कुछ हिस्सा रखती है ताकि दोनों ज़रूरी हों। बार-बार का द्विगुणन जीन-कुल बना देता है — ग्लोबिन, परिवर्धन वाले अध्याय के Hox गुच्छे, किसी चूहे के हज़ार घ्राण ग्राही जीन, जिनका तिहाई मनुष्यों में आभासी जीन है। नए जीनों का दूसरा स्रोत क्षैतिज अंतरण है: जीवाणु असंबंधित जीवाणुओं से जीन प्लास्मिडों, फ़ेजों तथा मुक्त DNA द्वारा पा लेते हैं, और इसी से किसी अस्पताल में प्रतिजैविक-प्रतिरोध जातियाँ पार करता है और इसीलिए किसी जीवाणु की “जाति” कोई क्रोड जीनोम है जिसे कोई खिसकता बादल घेरे है; सुकेंद्रकियों में अंतरण बिरला है पर असली है — वह T-DNA जो Agrobacterium पौधों में डालता है, ब्डेलॉइड रोटिफ़रों में जीवाणु-जीन, और वे प्राचीन थोक अंतरण जो सूत्रकणिका तथा हरितलवक थे। जहाँ अंतरण आम है वहाँ जीवन का इतिहास कोई जाल है, और किसी भी एक जीन से खींचा गया वृक्ष उसी जीन का वृक्ष है।