कोई जीवाणु किसी प्रतिजैविक का प्रतिरोध पाँच में से किसी एक उपाय से करता है। वह औषध नष्ट कर देता है: -लैक्टमेज़ -लैक्टम वलय का जल-अपघटन करती हैं, और विस्तारित-वर्णक्रम तथा कार्बापेनेमेज़ रूपांतर अब नवीनतम औषधों को भी नष्ट कर देते हैं। वह लक्ष्य बदल देता है: किसी राइबोसोमी प्रोटीन या गाइरेज़ में, जिससे औषध बँधती है, कोई उत्परिवर्तन, या MRSA (मेथिसिलिन-प्रतिरोधी Staphylococcus aureus) में किसी तिर्यक-बंधक एंज़ाइम का कोई अर्जित जीन जिससे -लैक्टम बँधते ही नहीं; वैनकोमाइसिन प्रतिरोध अंतिम D-Ala की जगह D-लैक्टेट रख देता है, जिसे औषध पहचानती ही नहीं। वह औषध को बहिःस्राव पंपों से बाहर धकेल देता है, जो प्रायः विशिष्टता में चौड़े होते हैं। वह कोई पोरिन खोकर औषध का भीतर आना रोक देता है। या वह रुके चरण को किसी वैकल्पिक एंज़ाइम से बाईपास कर देता है। लक्ष्य-उत्परिवर्तन रोगी में संयोग से प्रति विभाजन से की दरों पर उठते हैं और उपचार के दौरान चुन लिए जाते हैं; एंज़ाइम और पंप अधिकतर मिट्टी तथा आँत के जीवाणुओं के विशाल भंडार से प्लाज़्मिडों पर अर्जित होते हैं, जिनमें वे युगों तक उन प्रतिजैविकों के विरुद्ध विकसित हुए जो कवक और दूसरे जीवाणु बनाते हैं। अटल कोशिकाएँ — वे सुप्त कोशिकाएँ जो आनुवंशिक रूप से प्रतिरोधी हुए बिना किसी औषध से बच जाती हैं — उन पुनरावर्तनों की व्याख्या करती हैं जो ऐसे उपचार के बाद होते हैं जिसे काम करना चाहिए था।
उदाहरण
उदाहरण 12.13 (उत्परिवर्ती-चयन खिड़की)
किसी प्रजाति का MIC है; उसके प्रथम-चरण प्रतिरोधी उत्परिवर्ती, जो में एक मौजूद हैं, का MIC है। ऐसी कोई मात्रा जो औषध को पर थामे रखे, वन्य-प्ररूप को मार देती है और उत्परिवर्तियों को बिना किसी प्रतिस्पर्धा के बढ़ने देती है: वन्य-प्ररूप के MIC और उत्परिवर्तियों के MIC के बीच की सांद्रता-परास ही उत्परिवर्ती-चयन खिड़की है, और जो उपचार उसमें बैठा रहे वह प्रतिरोध पनपाता है। से ऊपर की मात्रा दोनों को मार देती है; बहुत कम मात्रा, या ऐसा कोर्स जो रोगी के अच्छा महसूस करते ही रोक दिया जाए जब औषध का स्तर खिड़की से होकर गिर रहा हो, इसी तरह कोई प्रतिरोधी समष्टि बनती है। यही तर्क यक्ष्मा-उपचार की विधियाँ तय करता है: छह महीने, चार औषधें, और हर एक-चरण उत्परिवर्ती के MIC से ऊपर की मात्राएँ।