किसी कोशिका का उपापचय उन सभी रासायनिक अभिक्रियाओं का समुच्चय है जो उसके भीतर चलती हैं: वे भी जो ऊर्जा छोड़ने के लिए अणुओं को तोड़ती हैं, और वे भी जो सरल अणुओं से कोशिका के अपने अणु बनाती हैं। उपापचय की हर अभिक्रिया को कोई एंजाइम चलाता है, यानी ऐसा प्रोटीन जो किसी एक विशिष्ट अभिक्रिया को तेज़ करता है पर ख़ुद उसमें ख़र्च नहीं होता।
उदाहरण
उदाहरण 4.3 (एक एंजाइम काम पर)
कच्चे यकृत या आलू के टुकड़े पर हाइड्रोजन परॉक्साइड डालिए: ऑक्सीजन छूटते ही वह ज़ोर से झाग उठता है। एंजाइम कैटेलेज़, जो लगभग हर कोशिका में है, विषैले परॉक्साइड को जल और ऑक्सीजन में तोड़ता है — प्रति एंजाइम अणु प्रति सेकंड लाखों अणुओं की दर से। यकृत को पहले उबाल दीजिए तो कुछ नहीं होता: वह एंजाइम, जो एक प्रोटीन है, ऊष्मा से नष्ट हो चुका है। और पत्थर पर डाला गया परॉक्साइड बिना बुलबुलों के पड़ा रहता है, जो दिखाता है कि अभिक्रिया अपने आप नहीं चलती।
उदाहरण 4.6 (युग्लीना, एक साथ दोनों)
एककोशिकीय Euglena में हरितलवक होते हैं और वह एक कशाभिका से तैरती है। प्रकाश में, खनिज जल में वह बढ़ती है: यानी स्वपोषी। अँधेरे में वह तभी बची रहती है जब पानी में कार्बनिक अणु मिलाए जाएँ, जिन्हें वह सोख लेती है: यानी परपोषी। लंबे समय तक अँधेरे में रखने पर वह अपने हरितलवक खो देती है; और कुछ दिनों के धीरज के साथ प्रकाश में लौटाने पर वह उन्हें दोबारा बना लेती है। उसका उपापचय उसके जीनों पर निर्भर है, जो दोनों विकल्प खुले रखते हैं, और उसके पर्यावरण पर, जो उनमें से एक चुन लेता है।
उदाहरण 4.9 (हवा में और हवा के बिना खमीर)
जिस खमीर में हवा के बुलबुले छोड़े जाएँ वह ग्लूकोज़ कम ख़र्च करता है और तेज़ी से बढ़ता है: वह श्वसन करता है। वही खमीर बंद टंकी में ग्लूकोज़ लालच से ख़र्च करता है, कम बढ़ता है और इथेनॉल बनाता है: वह किण्वन करता है। पास्तर ने, जिन्होंने 1861 में इसका वर्णन किया, किण्वन को “हवा के बिना जीवन” कहा था; कोशिकाएँ अपना उपापचय उसी पथ पर मोड़ लेती हैं जिसकी उनका पर्यावरण छूट दे, और चूँकि किण्वन प्रति ग्लूकोज़ इतनी कम ऊर्जा देता है, इसलिए जीने के लिए उन्हें कहीं अधिक चीनी फूँकनी पड़ती है।