थोड़े-से को छोड़कर हर जीवाणु पेप्टिडोग्लाइकन की दीवार में बंद है: बारी-बारी से N-ऐसीटिलग्लूकोसैमीन और N-ऐसीटिलम्यूरैमिक अम्ल की शृंखलाएँ, जो छोटे पेप्टाइडों से तिर्यक-बद्ध होकर एक ही अणु बन जाती हैं और कोशिका को घेरकर कोशिकाद्रव्य के स्फीति-दाब — कई वायुमंडल — का प्रतिरोध करती हैं। ग्राम-धनात्मक जीवाणुओं की दीवार मोटी होती है, की, कई परतों वाली, और उसमें टाइकोइक अम्ल पिरोए रहते हैं; ग्राम-ऋणात्मक जीवाणुओं की दीवार एक-दो परतों की पतली होती है और उसके बाहर एक दूसरी लिपिड द्विपरत, यानी बाह्य झिल्ली, जिसका बाहरी पटल लिपोपॉलिसैकेराइड (LPS, अंतर्विष — वही अणु जिसे अध्याय 15 का जन्मजात प्रतिरक्षा-तंत्र पहचानता है और जो पूतिज आघात करता है) है और जो किसी परिकोशिकाद्रव्य को घेरे रहती है। बाह्य झिल्ली के पोरिन छोटे अणुओं को आने देते हैं और अनेक प्रतिजैविकों को रोक देते हैं। बाहर भक्षकाणुओं के विरुद्ध कोई पॉलिसैकेराइड संपुट, तैरने के लिए कशाभ (अध्याय 9) और जुड़ाव तथा संयुग्मन के लिए पिली हो सकते हैं। भीतर गुणसूत्र — अधिकांश जातियों में का एक ही वलयाकार अणु — बिना किसी झिल्ली के किसी केंद्रकाभ में मुड़ा रहता है, और साथ में प्लाज़्मिड। कुछ वंश (Bacillus, Clostridium) गुणसूत्र की एक प्रति को किसी मोटे आवरण में अंतःबीजाणु के रूप में बंद कर सकते हैं, जो निर्जलित और उपापचय की दृष्टि से निष्क्रिय होता है, उबलना, विकिरण और सदियों का सूखा झेल जाता है, और पोषक लौटने पर अंकुरित होता है।
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