L’ammonium entre dans la matière organique presque uniquement par le glutamate : la glutamate déshydrogénase l’ajoute à l’-cétoglutarate, et la glutamine synthétase en ajoute un second à la chaîne latérale du glutamate (un ATP), ce qui donne la glutamine. À partir de ces deux donneurs, les transaminases (aminotransférases, à coenzyme dérivé de la vitamine B) déplacent le groupe aminé sur n’importe quel acide -cétonique, bâtissant des acides aminés à partir des squelettes carbonés des voies centrales : la famille du glutamate depuis l’-cétoglutarate, la famille de l’aspartate depuis l’oxaloacétate, l’alanine et la sérine depuis le pyruvate et le 3-phosphoglycérate. Les végétaux et les bactéries les fabriquent tous les vingt ; les animaux ont perdu les longues voies menant à neuf d’entre eux, les acides aminés indispensables, qu’ils prennent dans leur nourriture. Les mêmes transaminases, à l’envers, ôtent l’azote des acides aminés excédentaires pour l’excréter en ammoniac (poissons), en urée (mammifères) ou en acide urique (oiseaux, insectes).
Exemples
Exemple 16.10 (Les nucléotides)
Un cycle purique est assemblé sur du ribose-5-phosphate à partir de glycine, d’aspartate, de deux glutamines, de deux unités à un carbone et de , au prix de six ATP ; une pyrimidine à partir d’aspartate et de carbamoyl phosphate. Les désoxynucléotides sont faits à partir des ribonucléotides par réduction du sucre, avec du NADPH. Une cellule sur le point de se diviser fabrique quelque nucléotides en une heure ; les médicaments qui bloquent ces synthèses — méthotrexate, 5-fluorouracile — arrêtent d’abord les cellules en division, et c’est pourquoi ils traitent les cancers.