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जीवविज्ञान · शब्दावली

पेप्टाइड बंध, बहुपेप्टाइड क्या है?

अन्य नाम: पेप्टाइड बंध · बहुपेप्टाइड · प्रोटीन

परिभाषा 12.3 विश्वविद्यालय जीवविज्ञान — वर्ष 1 · अध्याय 12 — ऐमीनो अम्ल और प्रोटीन

पेप्टाइड बंध किसी एक ऐमीनो अम्ल के कार्बोक्सिल को अगले के ऐमीनो समूह से संघनन द्वारा जोड़ता है (एक ऐमाइड बंध, CONH\mathrm{-CO{-}NH-})। इस तरह जुड़े ऐमीनो अम्लों की शृंखला एक बहुपेप्टाइड है: दोहराती NCαC\mathrm{N{-}C_\alpha{-}C} इकाइयों की एक रीढ़, जिससे पार्श्व शृंखलाएँ बाहर निकली रहती हैं, और जिसका एक N-सिरा (मुक्त ऐमीनो समूह) तथा एक C-सिरा (मुक्त कार्बोक्सिल) होता है। अनुक्रम N से C की ओर लिखे जाते हैं, यानी संश्लेषण के क्रम में (अध्याय 19)। कोई प्रोटीन एक या अधिक बहुपेप्टाइड हैं जो किसी निश्चित आकृति में मुड़े हों; प्रारूपिक शृंखलाओं में 100 to 1000100\text{ to }1000\, अवशेष होते हैं जिनका माध्य द्रव्यमान 110Da110\,\mathrm{Da} है, इसलिए 300300\, अवशेषों का कोई प्रोटीन 33kDa33\,\mathrm{kDa} का है।

दो पेप्टाइड बंध। हर छायांकित तल छह परमाणुओं को कड़ाई से थामे है; शृंखला केवल  कार्बनों पर, कोणों  और  से मुड़ती है।
दो पेप्टाइड बंध। हर छायांकित तल छह परमाणुओं को कड़ाई से थामे है; शृंखला केवल α\alpha कार्बनों पर, कोणों ϕ\phi और ψ\psi से मुड़ती है।

उदाहरण

उदाहरण 12.10 (कोलैजन)

किसी स्तनधारी के प्रोटीन का एक-चौथाई कोलैजन है: तीन शृंखलाएँ, जिनमें से हर एक एक हज़ार अवशेषों की वामावर्त कुंडली है जिसमें हर तीसरे स्थान पर ग्लाइसीन है (ग्लाइ–X–Y, जिसमें Y प्रायः हाइड्रॉक्सीप्रोलीन है), और जो आपस में लिपटकर 300nm300\,\mathrm{nm} लंबी एक दक्षिणावर्त तिहरी कुंडली बनाती हैं, और फिर अगल-बगल जमकर ऐसे तंतुक बनाती हैं जिन्हें सहसंयोजी बंध आपस में बाँधते हैं। ग्लाइसीन में पार्श्व शृंखला का न होना ही तीनों शृंखलाओं को अक्ष पर जमने देता है; और ग्लाइसीन की जगह किसी और अवशेष का एक ही प्रतिस्थापन कुंडली में मोड़ डाल देता है और हड्डियाँ भुरभुरी कर देता है। प्रोलीनों के हाइड्रॉक्सिलीकरण के लिए विटामिन C चाहिए; उसके बिना कुंडली अस्थिर रहती है और तंतुक चूक जाते हैं: स्कर्वी।

उदाहरण 12.15 (कोई जेल पढ़ना)

किसी कच्चे निष्कर्ष में दर्जनों पट्टियाँ दिखती हैं; बंधुता वर्णलेखन के बाद 33kDa33\,\mathrm{kDa} सूचक की स्थिति पर एक ही पट्टी बचती है। SDS के बिना और अपचायक के बिना चलाने पर वही प्रोटीन 66kDa66\,\mathrm{kDa} की स्पीशीज़ के रूप में चलता है: वह दो एक जैसी शृंखलाओं का द्विलक है जिन्हें कोई डाइसल्फ़ाइड सेतु थामे है, और जिसे अपचायक तोड़ देता है तथा अपमार्जक अलग कर देता है। दो जेल, तर्क की एक ही लड़ी, और चतुष्क संरचना पता चल जाती है।

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