الرابطة الببتيدية تصل كربوكسيل حمض أميني بالزمرة الأمينية للتالي بالتكاثف (وهي رابطة أميدية، ). وسلسلة من الحموض الأمينية موصولة هكذا هي عديد ببتيد: أي هيكل من وحدات متكررة تبرز منها السلاسل الجانبية، ذات نهاية N (زمرة أمينية حرة) ونهاية C (كربوكسيل حر). وتُكتب التسلسلات من N إلى C، وهو ترتيب التصنيع (الفصل 19). والبروتين عديد ببتيد واحد أو أكثر مطوي في شكل محدد؛ والسلاسل النموذجية فيها بقية كتلتها الوسطية ، فبروتين من بقية كتلته .
أمثلة
مثال 12.10 (الكولاجين)
ربع بروتين الثديي كولاجين: ثلاث سلاسل، كل منها لولب يساري من ألف بقية بغليسين في كل موضع ثالث (غليسين–X–Y، وY هيدروكسي برولين غالبًا)، ملتفة معًا في لولب ثلاثي يميني طوله ، ثم مرصوصة جنبًا إلى جنب في ليفيفات تربطها روابط تساهمية. وانعدام السلسلة الجانبية عند الغليسين هو ما يتيح للسلاسل الثلاث أن ترتص عند المحور؛ واستبدال بقية أخرى بغليسين واحد يثني اللولب فيعطي عظامًا هشة. وفيتامين C لازم لهدرجة البرولينات بالهيدروكسيل؛ ودونه يكون اللولب غير مستقر وتفشل الليفيفات: وهو الأسقربوط.
مثال 12.15 (قراءة هلام)
مستخلص خام يظهر عشرات الحزم؛ وبعد استشراب الألفة تبقى حزمة واحدة عند موضع علامة . وإذا أُجري الرحلان بلا SDS وبلا عامل مرجع، هاجر البروتين نفسه بوصفه نوعًا كتلته : فهو ثنائي من سلسلتين متطابقتين يمسكهما جسر ثنائي الكبريت، يكسره العامل المرجع ويفصله المنظف. هلامان، وخط استدلال واحد، وتُعرف البنية الرابعية.