अभिक्रिया निर्देशांक, ऊर्जा प्रोफ़ाइल, संक्रमण अवस्था क्या है?

किसी मूल चरण के दौरान परमाणु अभिकारकों की व्यवस्था से उत्पादों की व्यवस्था की ओर जाते हैं; इस प्रगति को मापने वाला चर (कोई आबंध लंबाई जो बढ़ती है, कोई दूसरी जो घटती है) अभिक्रिया निर्देशांक है। उसके अनुदिश निकाय की स्थितिज ऊर्जा का आलेख ऊर्जा प्रोफ़ाइल है। इसका उच्चिष्ठ संक्रमण अवस्था है, परमाणुओं की ऐसी व्यवस्था जिसमें आबंध आधे बने और आधे टूटे होते हैं, जो एक आण्विक कंपन से अधिक नहीं टिकती और जिसे पृथक नहीं किया जा सकता। अभिकारकों के ऊपर इस उच्चिष्ठ की ऊँचाई चरण का ऊर्जा अवरोध है।