Sebuah pohon filogenetik adalah diagram kekerabatan sehimpunan spesies (atau kelompok lain). Ujung-ujungnya adalah spesies yang dibandingkan; setiap simpul tempat dua cabang bertemu mewakili nenek moyang bersama terkini mereka — sebuah populasi hipotetis, bukan fosil yang dikenal; akarnya adalah nenek moyang bersama semuanya. Dua spesies lebih dekat kerabatnya daripada spesies ketiga bila nenek moyang bersama keduanya (simpulnya) lebih muda daripada simpul yang dibagi keduanya dengan spesies ketiga itu. Kekerabatan dibaca dari simpul, tak pernah dari kedudukan ujung dari kiri ke kanan.
Contoh
Contoh 26.3 (Salah baca yang harus dihindari)
“Manusia berasal dari simpanse”: tidak — pada pohon itu, manusia dan simpanse adalah ujung bersaudari, keturunan satu nenek moyang bersama yang bukan keduanya. “Katak lebih primitif”: tidak — setiap ujung adalah spesies masa kini dengan panjang sejarah yang sama sejak akarnya; garis keturunan katak telah berevolusi selama garis keturunan kita. “Kadal lebih dekat kepada katak daripada kepada mencit” (dari pohon A): tidak — kadal dan mencit berbagi simpul yang lebih muda.