Coachيمر كل فيروس بالمراحل نفسها. الالتصاق بمستقبل مضيف بعينه — CD4 ومستقبل كيموكين في HIV، وACE2 في فيروسات كورونا السارسية، وحمض السياليك في الإنفلونزا، و عديد سكريد شحمي أو بورين في العاثية — وهو يقرر أي الأنواع وأي الخلايا يستطيع الفيروس أن يخمجها (وهو مداره). والدخول: اندماج الغلاف بالغشاء الهيولي، أو التقام يتبعه اندماج من داخل الجسيم الداخلي الحمضي، أو، في العاثية، حقن الجينوم عبر الجدار. ونزع الغلاف، و التعبير عن المورّثات الفيروسية بالطريق الخاص بالصنف، و تضاعف الجينوم، في مصنع يبنيه الفيروس غالبًا في الهيولى أو النواة. والتجميع: تجميع قفيصات جديدة حول جينومات جديدة، يقوده التجمع الذاتي للوحدات المتناظرة، و الإطلاق: إما بحلّ الخلية، وإما بالتبرعم عبر غشاء، وهو ما يوفر الغلاف. وبعض الفيروسات يستطيع بدلًا من ذلك أن يقحم جينومه في جينوم المضيف وينتظر: وهو الاندماج اللايسوجيني في العاثية ، التي يبقيها كابحها صامتة حتى يتأذى المضيف؛ و كمون فيروسات الهربس في العصبونات مدى الحياة وكمون HIV فيروسًا مندمجًا في الخلايا التائية الساكنة، ولا يزيله منها أي دواء يعمل على التضاعف.
示例
مثال 13.6 (HIV قبل المعادلات وبعدها)
حتى عام 1995 كانت سنوات الكمون السريري في خمج HIV — أي حمل فيروسي ثابت قدره – نسخة في المليلتر وهبوط بطيء في الخلايا التائية — تُقرأ فيروسًا هادئًا. فأعطى هو وبيرلسون وزملاؤهما المرضى مثبط بروتياز وطابقوا هبوط الحمل الفيروسي على المبرهنة: فأعطى الطور السريع (أي عمر نصف للفيريون قدره نحو ست ساعات)، وأعطى الطور البطيء (فتعيش الخلية المخموجة نحو يوم ونصف). و الحمل الثابت البالغ في المليلتر في من سوائل الجسم، المصفّى بمعدل ، يقتضي إذن إنتاج نحو فيريون في اليوم، كل يوم، سنين: فالفترة “الكامنة” حالة مستقرة محمومة من الخمج والموت، ومخزون الخلايا التائية يُستبدل يوميًا حتى يخفق. ويتبع حساب الطفرات في القسم التالي فورًا، ومعه سبب إخفاق الأدوية المفردة ونجاح الثلاثة.