Biologi · Glosarium

Apa itu Asam amino?

Dikenal juga sebagai: rantai samping · zwitterion

Definisi 12.1 Biologi Universitas — Tahun 1 · Bab 12 — Asam Amino dan Protein

Sebuah asam amino memiliki sebuah karbon α\alpha di pusat yang membawa sebuah gugus amino (NH2-\mathrm{NH_2}), sebuah gugus karboksil (COOH-\mathrm{COOH}), sebuah hidrogen dan sebuah rantai samping RR yang membedakan kedua puluh asam amino baku protein. Pada pH sel gugus aminonya terprotonasi dan karboksilnya terion: molekulnya adalah sebuah zwitterion, +H3NCHRCOO\mathrm{^+H_3N{-}CHR{-}COO^-}, tanpa muatan bersih. Karbon α\alpha bersifat kiral pada semuanya kecuali glisina, dan makhluk hidup hanya memakai enantiomer L. Rantai sampingnya berkelompok menurut kimianya:

golonganasam amino (kode tiga dan satu huruf)rantai samping
nonpolar, alifatikGly G, Ala A, Val V, Leu L, Ile I, Met M, Pro Phidrokarbon; Pro cincin
aromatikPhe F, Tyr Y, Trp Wcincin; Tyr, Trp menyerap UV
polar tak bermuatanSer S, Thr T, Cys C, Asn N, Gln Q-OH, -SH, amida
bermuatan positifLys K, Arg R, His Hbasa; His pKaK_a 6.0
bermuatan negatifAsp D, Glu Ekarboksilat, pKaK_a 4

Sembilan di antaranya (His, Ile, Leu, Lys, Met, Phe, Thr, Trp, Val) bersifat esensial bagi manusia: kita tak sanggup membuatnya dan harus memakannya.

Titrasi glisina. Dua dataran penyangga, pada pK_a karboksil dan gugus aminonya; di antara keduanya, pada titik isolistriknya, zwitterionnya tidak membawa muatan bersih.
Titrasi glisina. Dua dataran penyangga, pada pKaK_a karboksil dan gugus aminonya; di antara keduanya, pada titik isolistriknya, zwitterionnya tidak membawa muatan bersih.

Contoh

Contoh 12.10 (Kolagen)

Seperempat protein sebuah mamalia adalah kolagen: tiga rantai, yang masing-masing sebuah heliks tangan kiri berisi seribu residu dengan glisina pada tiap kedudukan ketiga (Gly–X–Y, Y sering hidroksiprolina), yang terpilin bersama menjadi heliks rangkap tiga tangan kanan sepanjang 300nm300\,\mathrm{nm}, lalu berkemas berdampingan menjadi fibril yang bersilang ikat lewat ikatan kovalen. Ketiadaan rantai samping pada glisinalah yang membuat ketiga rantainya dapat berkemas pada sumbunya; satu penggantian glisina oleh residu mana pun menekuk heliksnya dan memberikan tulang yang rapuh. Vitamin C dibutuhkan untuk menghidroksilasi prolinanya; tanpanya heliksnya tidak mantap dan fibrilnya gagal: penyakit sariawan.

Baca dalam konteks →