Pada eukariot polimerasenya tak pernah mulai sendiri: faktor umum pada promotornya (Bab 19) merekrutnya, dan lajunya ditetapkan faktor transkripsi yang terikat pada urutan pengatur — sebagian dekat promotornya, banyak dalam penguat yang dapat terletak ribuan pasangan basa jauhnya, di hulu, di hilir atau di dalam sebuah intron, pada arah hadap mana pun, dan bekerja lewat penggelungan DNA-nya sehingga faktor yang terikat padanya menyentuh kompleks promotornya lewat protein perantara. Sebuah faktor transkripsi bersifat bermodul: sebuah ranah pengikat DNA yang mengenali sebuah urutan pendek (keluarga heliks-belok-heliks, jari seng, ritsleting leusina) dan sebuah ranah pengaktif atau penekan yang merekrut atau menghalangi mesinnya. Sebuah gen dibaca ketika gabungan faktor yang tepat hadir: beberapa ratus faktor, dalam gabungan, mengendalikan dua puluh ribu gen.
Contoh
Contoh 20.11 (Sebuah isyarat menjadi sebuah pola pengungkapan)
Kortisol masuk ke sebuah sel hati lalu mengikat reseptornya, yaitu sebuah faktor transkripsi yang dijaga tak aktif dalam sitosolnya; kompleksnya masuk ke intinya, mengikat sebuah urutan lima belas basa yang hadir dekat seratus gen — gen glukoneogenesisnya termasuk (Bab 16) — lalu merekrut asetilase dan perantaranya: dalam sejam enzim sintesis glukosanya sedang dibuat. Hormon yang sama dalam sebuah limfosit, yang kromatin terbukanya memaparkan perangkat urutan itu yang berbeda, menyalakan gen yang membunuh selnya. Satu isyarat, satu reseptor, dua tanggapan: perbedaannya adalah gen mana yang terjangkau.