De replicatie begint bij een oorsprong — één op het bacteriechromosoom, tienduizenden op een eukaryoot genoom — waar de helix wordt geopend en twee replicatievorken in tegengestelde richting weglopen. Bij elke vork ontwindt een helicase de helix (één ATP per basenpaar), houden enkelstrengbindende eiwitten de gescheiden strengen uit elkaar, en heft een topo-isomerase vóór de vork de torsie op die het ontwinden opbouwt. Het DNA-polymerase voegt nucleotiden alleen aan de -hydroxylgroep van een bestaande keten toe, zodat elke nieuwe streng groeit en geen enkele uit het niets kan beginnen: een primase legt eerst een korte RNA-primer neer die het polymerase verlengt. Op de matrijs die wordt gelezen groeit de nieuwe streng ononderbroken naar de vork toe: de leidende streng. Op de andere matrijs moet de nieuwe streng van de vork af groeien, in stukken van nucleotiden bij bacteriën en bij eukaryoten, de okazakifragmenten, elk met een eigen primer: de volgende streng. Een tweede polymerase vervangt de primers door DNA en een ligase verbindt de fragmenten tot één streng.
Voorbeelden
Voorbeeld 18.4 (Snelheid en startpunten)
Een bacteriële vork beweegt met basenparen per seconde: twee vorken kopiëren de van E. coli in , en in een rijk medium, waar de cel elke twintig minuten deelt, begint er een nieuwe ronde voordat de vorige klaar is. Een eukaryote vork, door het chromatine vertraagd, beweegt met per seconde: een menselijk chromosoom van vanuit één oorsprong kopiëren zou een maand kosten, en daarom wordt het genoom vanuit zo’n oorsprongen in acht uur gekopieerd, in een volgorde die per celtype vastligt.